RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
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PTPRM-211ENST00000580170 C17orf58Q2M2W7 97 aa17.12■□□□□ 0.33
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PTPRM-211ENST00000580170 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
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PTPRM-211ENST00000580170 DEFB130AP0DP74 79 aa17.09■□□□□ 0.33
PTPRM-211ENST00000580170 GATA4P43694 442 aa17.09■□□□□ 0.33
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PTPRM-211ENST00000580170 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa17.08■□□□□ 0.33
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