RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571409.1

CTDNEP1-206, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 741 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR10J6PQ8NGY7 276 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM210BQ96KR6 192 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC25A31Q9H0C2 315 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 AZU1P20160 251 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR5C1Q8NGR4 320 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 MARVELD1Q9BSK0 173 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 NPCDR1Q9BY65 106 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF586Q9NXT0 402 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 LYRM9A8MSI8 78 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 CYCSP99999 105 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 THAP6Q8TBB0 222 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-206ENST00000571409 H0YIZ8 118 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 DEFA1P59665 94 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 DEFA3P59666 94 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 DNAH6Q9C0G6 4158 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 PLAC8L1A1L4L8 177 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 HTN1P15515 57 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 TAS2R60P59551 318 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 POM121L12Q8N7R1 296 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF253O75346 499 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 H2BFSP57053 126 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 CLINT1Q14677 625 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 KIR3DS1Q14943 382 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 GCSAMLQ5JQS6 135 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM14CQ9P0S9 112 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 TRBV19A0A075B6N1 114 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 DEFB130BP0DP73 79 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 DEFB130AP0DP74 79 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 DNAH10Q8IVF4 4471 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 SSNA1O43805 119 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 PYYP10082 97 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM88Q6PEY1 159 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 C16orf74Q96GX8 76 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 C20orf144Q9BQM9 153 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-206ENST00000571409 H7BYZ3 331 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 FCN2Q15485 313 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 GFI1BQ5VTD9 330 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 NPIPB6E9PJ23 425 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 CT45A10P0DMU9 189 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 BATF3Q9NR55 127 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 TIMM9Q9Y5J7 89 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 M0R3E3 92 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 NDUFB4O95168 129 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 BLNKQ8WV28 456 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC25A2Q9BXI2 301 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 J3KRW8 73 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 PDE6HQ13956 83 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 ZNF493Q6ZR52 646 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 ODF3Q96PU9 254 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 KCNIP2Q9NS61 270 aa21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 MPC2O95563 127 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 LEPP41159 167 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 MIR17HGQ75NE6 70 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 PRELID1Q9Y255 219 aa21.41■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 PET100P0DJ07 73 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa21.4■■□□□ 1.02
CTDNEP1-206ENST00000571409 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 ATP5SQ99766 215 aa21.39■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 C17orf112F2Z3M2 114 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 F5H768 121 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 ERCC8Q13216 396 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 CCDC28AQ8IWP9 274 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 C15orf53Q8NAA6 179 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 AAMDCQ9H7C9 122 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 HSPB11Q9Y547 144 aa21.38■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 CBY3A6NI87 242 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 M0R2N4 97 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 ATP5G1P05496 136 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 ATP5G3P48201 142 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR51M1Q9H341 326 aa21.37■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 NBEAP1P0C6P0 100 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 RPL12P30050 165 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 ICAM4Q14773 271 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 RNF212Q495C1 297 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 FUT9Q9Y231 359 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 OR10J4P0C629 311 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 LINC00477Q96M19 166 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 PAXXQ9BUH6 204 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 SMIM3Q9BZL3 60 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 MBD2Q9UBB5 411 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 FAM122CQ6P4D5 195 aa21.33■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa21.33■■□□□ 1.01
CTDNEP1-206ENST00000571409 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa21.32■■□□□ 1
CTDNEP1-206ENST00000571409 FXYD5Q96DB9 178 aa21.32■■□□□ 1
CTDNEP1-206ENST00000571409 PYGO2Q9BRQ0 406 aa21.32■■□□□ 1
CTDNEP1-206ENST00000571409 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CTDNEP1-206ENST00000571409 IFNA5P01569 189 aa21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.6 ms