RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 H3BRN7 92 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 P0DMU3 169 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 FAM231AP0DMU4 169 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 FAM231CP0DMU5 169 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 GPR183P32249 361 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 ICAM4Q14773 271 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 OR1B1Q8NGR6 318 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 OR11H2Q8NH07 326 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF503Q96F45 646 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 CHRDL1Q9BU40 450 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TREM1Q9NP99 234 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 GNG13Q9P2W3 67 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.81□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1W2PRE2 83 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM213A2RRL7 107 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 A8MWP6 167 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 C16orf90A8MZG2 172 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 DEFB4AO15263 64 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 CDK2AP2O75956 126 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 APOC3P02656 99 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 IL4P05112 153 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 ORM2P19652 201 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 LYZP61626 148 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 MORN5Q5VZ52 161 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SVBPQ8N300 66 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 CSTL1Q9H114 145 aa6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 A0A1B0GV50 99 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 OR4C46A6NHA9 309 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 C9JQL5 133 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 NDUFA4O00483 81 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 PDE6DO43924 150 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SCO1O75880 301 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 IGHV3-23P01764 117 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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SMAD3-215ENST00000560424 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 UHRF2Q96PU4 802 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 OR51M1Q9H341 326 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 DOK5Q9P104 306 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 S4R3C0 116 aa6.79□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF98A6NK75 572 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 FAM74A7A6NL05 159 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 F6UZH7 168 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 F8W036 122 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 OR7C2O60412 319 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SNAPINO95295 136 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 ADCYAP1P18509 176 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 CRYBB3P26998 211 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 PDE6HQ13956 83 aa6.78□□□□□ -1.32
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SMAD3-215ENST00000560424 FAM74A3Q4VXF1 159 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 C11orf52Q96A22 123 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 FXYD5Q96DB9 178 aa6.78□□□□□ -1.32
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SMAD3-215ENST00000560424 PAXXQ9BUH6 204 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 RABAC1Q9UI14 185 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 UFC1Q9Y3C8 167 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 U3KQE9 123 aa6.78□□□□□ -1.32
SMAD3-215ENST00000560424 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 K7EMT4 169 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 TSPAN4O14817 238 aa6.77□□□□□ -1.33
SMAD3-215ENST00000560424 BUB3O43684 328 aa6.77□□□□□ -1.33
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