RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF137PP52743 207 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 HAMPP81172 84 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 IFITM3Q01628 133 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 BAXQ07812 192 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 C12orf74Q32Q52 190 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 DHFR2Q86XF0 187 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 OR1L1Q8NH94 360 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 OTOSQ8NHW6 89 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 LHFPL5Q8TAF8 219 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 STOML3Q8TAV4 291 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 RXFP4Q8TDU9 374 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 GHSRQ92847 366 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 TLCD1Q96CP7 247 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 SMIM12Q96EX1 92 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 FAM210BQ96KR6 192 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 FAAP24Q9BTP7 215 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 SCRT1Q9BWW7 348 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 V9GYS6 101 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 FAM223BA6NKX1 122 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 CCNKO75909 580 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 DCTN3O75935 186 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 SLC22A5O76082 557 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 S1PR2O95136 353 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 GABARAPO95166 117 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 TTRP02766 147 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 NBEAP1P0C6P0 100 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 APELAP0DMC3 54 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 TSPOP30536 169 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 SMIM11AP58511 58 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 HBG1P69891 147 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 HBG2P69892 147 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 RHOGP84095 191 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 ZFP1Q6P2D0 407 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 FAM223AQ8IWN6 122 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 CCDC90BQ9GZT6 254 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 ENPP4Q9Y6X5 453 aa2.93□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 RBFOX3A6NFN3 312 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 METTL15A6NJ78 407 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 DISC1C4P0D8 188 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 F8W036 122 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 UPK2O00526 184 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 PSPHP1O15172 72 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 PFDN1O60925 122 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 MED6O75586 246 aa2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 CDK5R1Q15078 307 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 PMVKQ15126 192 aa2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 Q6P435 159 aa2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 GPHB5Q86YW7 130 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 STX19Q8N4C7 294 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 SFRP2Q96HF1 295 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 SMIM8Q96KF7 97 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 OR10C1Q96KK4 312 aa2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 TMEM109Q9BVC6 243 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 TSSK6Q9BXA6 273 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 UFC1Q9Y3C8 167 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 FAT1Q14517 4588 aa2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 A8MWP6 167 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 C15orf65H3BRN8 121 aa2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 TAAR5O14804 337 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 ORC5O43913 435 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 PRH1P02810 166 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 MT-ND4P03905 459 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 SPART-AS1P0CW21 52 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 S100PP25815 95 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 EMP1P54849 157 aa2.91□□□□□ -1.94
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