RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RLN2P04090 185 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCN2Q15485 313 aa16.51■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CHAC2Q8WUX2 184 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C16orf74Q96GX8 76 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF586Q9NXT0 402 aa16.49■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLAC8L1A1L4L8 177 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A6NHS1 94 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MPDU1O75352 247 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NHLH2Q02577 135 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC25A31Q9H0C2 315 aa16.48■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H7BYZ3 331 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIR3DS1Q14943 382 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00336Q6ZUF6 198 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C20orf144Q9BQM9 153 aa16.47■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 J3KRW8 73 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRAF2O60831 178 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IFITM3Q01628 133 aa16.46■□□□□ 0.23
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF493Q6ZR52 646 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C15orf53Q8NAA6 179 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR5C1Q8NGR4 320 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THAP6Q8TBB0 222 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPCDR1Q9BY65 106 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NMES1Q9C002 83 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PTTG2Q9NZH5 202 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TIMM9Q9Y5J7 89 aa16.46■□□□□ 0.23
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CBY3A6NI87 242 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF253O75346 499 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP5G1P05496 136 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP5G3P48201 142 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CYCSP99999 105 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GFI1BQ5VTD9 330 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC28AQ8IWP9 274 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR5AC2Q9NZP5 309 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM14CQ9P0S9 112 aa16.45■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRBV19A0A075B6N1 114 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CT45A10P0DMU9 189 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LEPP41159 167 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LGALS9BQ3B8N2 356 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GCSAMLQ5JQS6 135 aa16.44■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPIPB6E9PJ23 425 aa16.43■□□□□ 0.22
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 CLINT1Q14677 625 aa16.43■□□□□ 0.22
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 ODF3Q96PU9 254 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATG101Q9BSB4 218 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRELID1Q9Y255 219 aa16.42■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa16.41■□□□□ 0.22
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUDT3O95989 172 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEFA1P59665 94 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEFA3P59666 94 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ERCC8Q13216 396 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDE6HQ13956 83 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MARVELD1Q9BSK0 173 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AAMDCQ9H7C9 122 aa16.4■□□□□ 0.22
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SSNA1O43805 119 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MIR17HGQ75NE6 70 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC25A2Q9BXI2 301 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KCNIP2Q9NS61 270 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NACAE9PAV3 2078 aa16.39■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRSS29PA6NIE9 313 aa16.38■□□□□ 0.21
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HOXC-AS1-201ENST00000505700 H2BFSP57053 126 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LINC00477Q96M19 166 aa16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C17orf112F2Z3M2 114 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ICAM4Q14773 271 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 Q6ZR54 194 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PYGO2Q9BRQ0 406 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR51M1Q9H341 326 aa16.37■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBEAP1P0C6P0 100 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa16.36■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAGE12BA1L429 117 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C7orf71A4D174 169 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAGE7O76087 117 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAGE12FP0CL80 117 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAGE12GP0CL81 117 aa16.35■□□□□ 0.21
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GAGE12IP0CL82 117 aa16.35■□□□□ 0.21
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