RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	THAP8	Q8NA92	274 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	IL22RA2	Q969J5	263 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		7.4	□□□□□ -1.22
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A096LPF7	62 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511		J3KRW8	73 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	NCS1	P62166	190 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PSG3	Q16557	428 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	AP3S1	Q92572	193 aa		7.39	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0B4J2A0	478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SMCO3	A2RU48	225 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511		H0YIZ8	118 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	NPS	P0C0P6	89 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5G3	P0C626	314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA3	P12429	323 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL3	P19876	107 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A7A	Q86SG5	101 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	YIPF6	Q96EC8	236 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR132	Q9UNW8	380 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		7.38	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BRN7	92 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	IL5	P05113	134 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	VBP1	P61758	197 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SRPX	P78539	464 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZTI0	123 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PRRT1	Q99946	306 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		7.37	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	HYPM	O75409	117 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	MED6	O75586	246 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAIN1	P0CW23	69 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM182	Q6ZP80	229 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		7.36	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	WRB	O00258	174 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PSCA	O43653	123 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF24	Q9Y225	148 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	FUT9	Q9Y231	359 aa		7.35	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087X0K7	114 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS5	O15539	181 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00869	P0C866	280 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	EVI2A	P22794	236 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	LEP	P41159	167 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	LCN15	Q6UWW0	184 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	MCUB	Q9NWR8	336 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		7.34	□□□□□ -1.23
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WXM4	84 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BP45	60 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	IGHV3-53	P01767	116 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL6	Q9H0F7	186 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNGR2	O43760	224 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	CXCL2	P19875	107 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENOT	P62341	195 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAC2	D3DTV9	90 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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