RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RGS21Q2M5E4 152 aa-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR10X1Q8NGY0 326 aa-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SIGMAR1Q99720 223 aa-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NAT8BQ9UHF3 227 aa-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ANK2Q01484 3957 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BBIP1A8MTZ0 92 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM114B3SHH9 223 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BANF1O75531 89 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLRXP35754 106 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COX6A2Q02221 97 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MIR22HGQ0VDD5 57 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 Q5XG85 94 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R14BQ96C90 147 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR2J1Q9GZK6 312 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-0.21□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C9orf170A2RU37 121 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ARL5CA6NH57 179 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HIGD1CA8MV81 97 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OGNP20774 298 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATP5G3P48201 142 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCSMST1Q4G0I0 132 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HACD4Q5VWC8 232 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PATE2Q6UY27 113 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM216BQ8N7L0 139 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR5AK2Q8NH90 309 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MALSU1Q96EH3 234 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC22A13Q9Y226 551 aa-0.22□□□□□ -2.44
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPAG17Q6Q759 2223 aa-0.22□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PIAS1O75925 651 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IGLV1-51P01701 117 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SDC4P31431 198 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ETV6P41212 452 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RPL35P42766 123 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMBIM6P55061 237 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DEFA3P59666 94 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DNAJB13P59910 316 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NEDD8Q15843 81 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR4B1Q8NGF8 309 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ISOC1Q96CN7 298 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR4C12Q96R67 309 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PBDC1Q9BVG4 233 aa-0.23□□□□□ -2.45
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CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CACNA1AO00555 2505 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa-0.23□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIIAD1A6NNX1 92 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C5orf58C9J3I9 102 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 G3V2T6 193 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 H7C1C5 153 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CST7O76096 145 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LY6G6CO95867 125 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERPINA1P01009 418 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CRHP06850 196 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IDO1P14902 403 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SERPINB9P50453 376 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCN6P62502 163 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CCL7P80098 99 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OR8J2Q8NGG1 315 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BIN3Q9NQY0 253 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C19orf12Q9NSK7 152 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SSR3Q9UNL2 185 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 WNK2Q9Y3S1 2297 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CELSR2Q9HCU4 2923 aa-0.24□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PTPRDP23468 1912 aa-0.25□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PPB8 328 aa-0.25□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 A0A1W2PRS3 328 aa-0.25□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIR3DP1A8MWS1 328 aa-0.25□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 F2Z2F3 143 aa-0.25□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRACP01848 142 aa-0.25□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRGC2P03986 189 aa-0.25□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 S100A6P06703 90 aa-0.25□□□□□ -2.45
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PPP1R2P41236 205 aa-0.25□□□□□ -2.45
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