RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485692.1

GTF3C5-209, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-209ENST00000485692 H3BTX0 84 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 H2AFB2P0C5Z0 115 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 SULT1A1P50225 295 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 VWC2Q2TAL6 325 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 MIC13Q5XKP0 118 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 NACAE9PAV3 2078 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 H3BQ15 152 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 S100A11P31949 105 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 S100A10P60903 97 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 HBG1P69891 147 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 HBG2P69892 147 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 STX12Q86Y82 276 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF3C5-209ENST00000485692 PRAC2D3DTV9 90 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF253O75346 499 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 NUDT3O95989 172 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 BAXQ07812 192 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 TMEM252Q8N6L7 170 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 CHAC2Q8WUX2 184 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 ODF3Q96PU9 254 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 IGSF23A1L1A6 192 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 MED14OSP0DP75 135 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 IL15RAQ13261 267 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 RAB32Q13637 225 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 KIR3DS1Q14943 382 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 MZT2BQ6NZ67 158 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 PKD1P98161 4303 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 PCLOQ9Y6V0 5065 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 LEPP41159 167 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 CCL18P55774 89 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 ATP6V1FQ16864 119 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 MPDU1O75352 247 aa14.66□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 CT45A10P0DMU9 189 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 FGF7P21781 194 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNRF2Q8NHG8 242 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 RNF141Q8WVD5 230 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF3C5-209ENST00000485692 SNURFLB1AK76 121 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 J3KRW8 73 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 RLN2P04090 185 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 CLINT1Q14677 625 aa14.64□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 ASAH1Q13510 395 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 PDE6HQ13956 83 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 S100ZQ8WXG8 99 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 PRELID1Q9Y255 219 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 M6PRP20645 277 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 OR5I1Q13606 314 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 LINC00588Q9Y4M8 146 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 GAGE12BA1L429 117 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 GAGE7O76087 117 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 GAGE12FP0CL80 117 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 GAGE12GP0CL81 117 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 GAGE12IP0CL82 117 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 ZNF503Q96F45 646 aa14.61□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 M0R3E3 92 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 NDUFB4O95168 129 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 SSX7Q7RTT5 188 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 LINC00477Q96M19 166 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 C7orf71A4D174 169 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 PYYP10082 97 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 C6orf223Q8N319 242 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 THAP6Q8TBB0 222 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 ENKURQ8TC29 256 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 SLC25A31Q9H0C2 315 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF3C5-209ENST00000485692 KLLNB2CW77 178 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF3C5-209ENST00000485692 E5RGE8 158 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms