RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-211	ENST00000429595		C9JCJ5	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595		H3BP45	60 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	GAGE7	O76087	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	IFNA10	P01566	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	FABP1	P07148	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	CXCL1	P09341	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	GAGE12F	P0CL80	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	GAGE12G	P0CL81	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	GAGE12I	P0CL82	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	HIST1H1B	P16401	226 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	FGF7	P21781	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	S100A2	P29034	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	AKR1C3	P42330	323 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	PRRX1	P54821	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	GAGE1	Q13065	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	GAGE4	Q13068	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	BATF2	Q8N1L9	274 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	OR5B3	Q8NH48	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	SLC35E1	Q96K37	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595		A0A087X0M5	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595		A0A1B0GX30	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595		A0A1W2PPV4	95 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	hADV38S2	A0JD32	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	ZFP92	A6NM28	416 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595		H7BYZ3	331 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	UPK2	O00526	184 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	GCG	P01275	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	TRGC2	P03986	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	OR10J4	P0C629	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	PSMB8	P28062	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	BMI1	P35226	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF137P	P52743	207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	DLX6	P56179	175 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	RHOB	P62745	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	DEFB125	Q8N687	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	RPE	Q96AT9	228 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	PARL	Q9H300	379 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	PSG11	Q9UQ72	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	OR11H12	B2RN74	326 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	C11orf94	C9JXX5	98 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	PPP5D1	E7EU14	171 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595		M0R1X1	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	FCGR3B	O75015	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	YIF1A	O95070	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	ESD	P10768	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	SSTR5	P35346	364 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	GALR1	P47211	349 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	NDUFA6	P56556	154 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PTPRK-211	ENST00000429595	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms