RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419857.1

EML3-204, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 3, human

TSL 4

Gene EML3, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EML3-204	ENST00000419857	UPK3B	Q9BT76	320 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857		Q9H8V8	135 aa		13.61	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	TTC32	Q5I0X7	151 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		13.6	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857		H3BQ15	152 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	ZNF253	O75346	499 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	CAMLG	P49069	296 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	RAB31	Q13636	194 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857		Q6ZRG5	221 aa		13.59	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
EML3-204	ENST00000419857		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	SNURFL	B1AK76	121 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857		L7N2F9	121 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	RLN2	P04090	185 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	LEP	P41159	167 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	VAMP2	P63027	116 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	OR5I1	Q13606	314 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857		Q9H3A6	140 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857		H3BTX0	84 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	CT45A10	P0DMU9	189 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	IL7	P13232	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	HOXA5	P20719	270 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	VWC2	Q2TAL6	325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	C18orf15	Q96N68	181 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	PFDN5	Q99471	154 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	GAGE12B	A1L429	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	GAGE7	O76087	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	GAGE12F	P0CL80	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	GAGE12G	P0CL81	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	GAGE12I	P0CL82	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	MIC13	Q5XKP0	118 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857		A0A0J9YY99	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	CCS	O14618	274 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	BCAP31	P51572	246 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	CAV2	P51636	162 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	ESRG	Q1W209	222 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	PLA2G10	O15496	165 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	CST7	O76096	145 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	PRELID1	Q9Y255	219 aa		13.53	□□□□□ -0.24
EML3-204	ENST00000419857	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	KLLN	B2CW77	178 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	LYRM1	O43325	122 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	S100A11	P31949	105 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	SULT1A1	P50225	295 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	PDE6H	Q13956	83 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857		Q6ZTI0	123 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	FAM19A4	Q96LR4	140 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	C2orf50	Q96LR7	162 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	C7orf71	A4D174	169 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857		J3KRW8	73 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	TCRB	P04435	133 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	LINC00477	Q96M19	166 aa		13.51	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	IL15RA	Q13261	267 aa		13.5	□□□□□ -0.25
EML3-204	ENST00000419857	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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