RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380956.8

IRF4-201, Transcript of interferon regulatory factor 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF4, Length 5,331 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4-201ENST00000380956 GFRALQ6UXV0 394 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 PRR20EP86478 221 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 PRR20CP86479 221 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 PRR20DP86480 221 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 PRR20BP86481 221 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 PRR20AP86496 221 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 CD3EP07766 207 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 FAM106CPP0CH98 169 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.72□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.71□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 A0A087WX48 190 aa11.71□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 C21orf140B9A014 251 aa11.71□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 TIMM21Q9BVV7 248 aa11.71□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 MGAMO43451 1857 aa11.71□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 Q6ZT83 130 aa11.71□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.71□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 FAM57AQ8TBR7 257 aa11.71□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
IRF4-201ENST00000380956 FXYD5Q96DB9 178 aa11.71□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.71□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 CFC1BP0CG36 223 aa11.71□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 CFC1P0CG37 223 aa11.71□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 IGHV1-2P23083 117 aa11.71□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 TMEM14BQ9NUH8 114 aa11.71□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.7□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 ERCC8Q13216 396 aa11.7□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 ZNF576Q9H609 170 aa11.7□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.7□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 CHCHD5Q9BSY4 110 aa11.7□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 SYNJ2BPP57105 145 aa11.7□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 C11orf1Q9H5F2 150 aa11.7□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 HIGD1BQ9P298 99 aa11.7□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 DDB2Q92466 427 aa11.7□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 IGHG4P01861 327 aa11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 PAX1P15863 534 aa11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 UTF1Q5T230 341 aa11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 CRPP02741 224 aa11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 SRD5A1P18405 259 aa11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 PRR7Q8TB68 274 aa11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 SPANXCQ9NY87 97 aa11.69□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 C16orf97H3BN30 126 aa11.68□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 VCYO14598 125 aa11.68□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 RPL32P62910 135 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa11.68□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 SPTA1P02549 2419 aa11.68□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.68□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 DUX5Q96PT3 197 aa11.68□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 ZNRD1Q9P1U0 126 aa11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 CR1LQ2VPA4 569 aa11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 ZNF876PQ49A33 203 aa11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 DTX2Q86UW9 622 aa11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 WNK2Q9Y3S1 2297 aa11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 GGNQ86UU5 652 aa11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 ODF3L1Q8IXM7 274 aa11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 GTSF1Q8WW33 167 aa11.67□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 DUX3Q96PT4 197 aa11.66□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.66□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 RBM3P98179 157 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.65□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 SRRM5B3KS81 715 aa11.65□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 J3QQQ9 107 aa11.65□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 LINC00158P58513 81 aa11.65□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa11.65□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.65□□□□□ -0.54
IRF4-201ENST00000380956 A0A087WWL8 130 aa11.65□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 NBR2O15453 112 aa11.65□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 CCDC179H3BU77 68 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 A0A1W2PPI3 338 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 TET1Q8NFU7 2136 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 IGLV3-1P01715 115 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 SPATA25Q9BR10 227 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 DPM3Q9P2X0 92 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 PATE3B3GLJ2 98 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 SMRP1Q8NCR6 262 aa11.64□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.63□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 A0A1B0GX51 115 aa11.63□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.63□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 CADP27708 2225 aa11.63□□□□□ -0.55
IRF4-201ENST00000380956 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.3 ms