RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370002.7

PITX3-201, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX3, Length 1,391 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-201ENST00000370002 NPCDR1Q9BY65 106 aa14.61□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.61□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 RFNGQ9Y644 331 aa14.61□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 AGRNO00468 2067 aa14.61□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 IGKV3-20P01619 116 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 Q6ZTC4 211 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 C20orf173Q96LM9 149 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 APLNQ9ULZ1 77 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 IGLL5B9A064 214 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 AGPAT2O15120 278 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 MBP02144 154 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 CAMLGP49069 296 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 DEFB1P60022 68 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 B2MP61769 119 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 BLOC1S1P78537 153 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 C12orf74Q32Q52 190 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 DPPA3Q6W0C5 159 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.6□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.59□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 F6UB75 175 aa14.59□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 AMTNQ6UX39 209 aa14.59□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 PATE2Q6UY27 113 aa14.59□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa14.59□□□□□ -0.07
PITX3-201ENST00000370002 NMBP08949 121 aa14.58□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 UHRF2Q96PU4 802 aa14.58□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 MGST2Q99735 147 aa14.58□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 HBE1P02100 147 aa14.57□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 CNN1P51911 297 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 Q6ZRG5 221 aa14.57□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.57□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.57□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 C1orf158Q8N1D5 194 aa14.57□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 FAM210BQ96KR6 192 aa14.57□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 CELA1Q9UNI1 258 aa14.57□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa14.56□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 RPL29P47914 159 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 FXYD7P58549 80 aa14.56□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.56□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 LCN15Q6UWW0 184 aa14.56□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.55□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 PSG3Q16557 428 aa14.55□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 RRN3P1Q2M238 152 aa14.55□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 FAM213BQ8TBF2 198 aa14.55□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.55□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.55□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.55□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa14.54□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 COX7A2P2O60397 106 aa14.54□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 ZNF738Q8NE65 137 aa14.54□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.54□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.54□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 DKK2Q9UBU2 259 aa14.54□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 M6PRP20645 277 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 PRR20EP86478 221 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 PRR20CP86479 221 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 PRR20DP86480 221 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 PRR20BP86481 221 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 PRR20AP86496 221 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 RNF182Q8N6D2 247 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 OR8A1Q8NGG7 326 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 PFDN5Q99471 154 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 SLC39A9Q9NUM3 307 aa14.53□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 LINC00862A6NCI5 91 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 TEX46H3BTG2 121 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 INSP01308 110 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 TSPOP30536 169 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 RAB2AP61019 212 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 GUK1Q16774 197 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 MIC13Q5XKP0 118 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 MED9Q9NWA0 146 aa14.52□□□□□ -0.08
PITX3-201ENST00000370002 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.51□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 CRXO43186 299 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.51□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.51□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 OR10G4Q8NGN3 311 aa14.51□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 OR10G9Q8NGN4 311 aa14.51□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 OR10G7Q8NGN6 311 aa14.51□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 KMT2AQ03164 3969 aa14.51□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 H2AFB1P0C5Y9 115 aa14.5□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 P0DMU3 169 aa14.49□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 FAM231AP0DMU4 169 aa14.49□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 FAM231CP0DMU5 169 aa14.49□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 IGLC2P0DOY2 106 aa14.49□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 FHITP49789 147 aa14.49□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 EMP1P54849 157 aa14.49□□□□□ -0.09
PITX3-201ENST00000370002 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms