RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35B3Q9H1N7 401 aa20.59■□□□□ 0.89
CTDNEP1-201ENST00000318988 STAB1Q9NY15 2570 aa20.59■□□□□ 0.89
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ODF3L2Q3SX64 289 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 LINC00477Q96M19 166 aa20.42■□□□□ 0.86
CTDNEP1-201ENST00000318988 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa20.42■□□□□ 0.86
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
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