RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 PRELID3AQ96N28 172 aa13.56□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa13.56□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 NBR2O15453 112 aa13.56□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 FGF6P10767 208 aa13.56□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 UQCRFS1P47985 274 aa13.56□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF493Q6ZR52 646 aa13.56□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 LYPD1Q8N2G4 141 aa13.56□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 SPTA1P02549 2419 aa13.56□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CACNA1BQ00975 2339 aa13.55□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 MED13LQ71F56 2210 aa13.55□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM189A5PLL7 270 aa13.55□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 B9A039 149 aa13.55□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 F8W735 103 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CACNG7P62955 275 aa13.55□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.55□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 FANCD2OSQ96PS1 177 aa13.55□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CD5LO43866 347 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 HLA-DMBP28068 263 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 GRNP28799 593 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 NDPQ00604 133 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 HES1Q14469 280 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 WFDC3Q8IUB2 231 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CST9LQ9H4G1 147 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 A0A1B0GW15 77 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CD3EP07766 207 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 NHLH1Q02575 133 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 Q6AWC8 147 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CFHR4Q92496 578 aa13.54□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 C7orf71A4D174 169 aa13.53□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.53□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa13.53□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 ORMDL3Q8N138 153 aa13.53□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 RABAC1Q9UI14 185 aa13.53□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 NPYP01303 97 aa13.52□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 TCF15Q12870 199 aa13.52□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 RNF5Q99942 180 aa13.52□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 VGLL1Q99990 258 aa13.52□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 U3KQK5 164 aa13.52□□□□□ -0.24
PDE4A-201ENST00000293683 NPIPB5A8MRT5 1133 aa13.52□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 GAS8-AS1O95177 125 aa13.52□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.52□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa13.51□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 MSRB1Q9NZV6 116 aa13.51□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 DPM3Q9P2X0 92 aa13.51□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 TWIST1Q15672 202 aa13.51□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 OCIAD2Q56VL3 154 aa13.51□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 PAX8Q06710 450 aa13.5□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 PDE6HQ13956 83 aa13.5□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF575Q86XF7 245 aa13.5□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 PRR25Q96S07 402 aa13.5□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 THYN1Q9P016 225 aa13.5□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 C5orf64Q2M2E5 130 aa13.5□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 PRSS57Q6UWY2 283 aa13.5□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 RAB1BQ9H0U4 201 aa13.5□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 NDUFA3O95167 84 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 CKS2P33552 79 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 MFAP4P55083 255 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 DYNAPQ8N1N2 210 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 GAGE12BA1L429 117 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 IGHG4P01861 327 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 PCP2Q8IVA1 136 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 NPBQ8NG41 125 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 C18orf15Q96N68 181 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 JMJD8Q96S16 334 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa13.49□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 FAM90A27PA6NNH2 459 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 HBDP02042 147 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 LGALS9BQ3B8N2 356 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 C21orf62Q9NYP8 219 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 DKK2Q9UBU2 259 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 ARPC1AQ92747 370 aa13.48□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.47□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 NMUP48645 174 aa13.47□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa13.47□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 OR11H6Q8NGC7 330 aa13.47□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 IFI27L1Q96BM0 104 aa13.47□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 VPS25Q9BRG1 176 aa13.47□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 PPIFP30405 207 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PDE4A-201ENST00000293683 ERCC8Q13216 396 aa13.46□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 NDUFS7O75251 213 aa13.45□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 IGLC6P0CF74 106 aa13.45□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 SEC11AP67812 179 aa13.45□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 PRAC2D3DTV9 90 aa13.45□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 ORM1P02763 201 aa13.45□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 PPBPP02775 128 aa13.45□□□□□ -0.26
PDE4A-201ENST00000293683 CTSGP08311 255 aa13.45□□□□□ -0.26
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