RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFSF12	O43508	249 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	IGLC1	P0CG04	106 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	BDKRB2	P30411	391 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVK-16	P61578	105 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	RSG1	Q9BU20	258 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	AK3	Q9UIJ7	227 aa		3.24	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	SNAPC5	O75971	98 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A5	O76082	557 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	RD3L	P0DJH9	198 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10J1	P30954	320 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	LEP	P41159	167 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	QRFP	P83859	136 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	GINS1	Q14691	196 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	NPIPB3	Q92617	1050 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	PRND	Q9UKY0	176 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		3.23	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	BIRC5	O15392	142 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	DIRAS3	O95661	229 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	ORM2	P19652	201 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	PSMB9	P28065	219 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPA13	P48723	471 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF90	Q03938	601 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	RASL10A	Q92737	203 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM262	E9PQX1	116 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440		K7EPK0	472 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	CD2	P06729	351 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2T7	P0C7T2	308 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SNCA	P37840	140 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	EFNB1	P98172	346 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	OR4A16	Q8NH70	328 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB3C	Q96E17	227 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00477	Q96M19	166 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	C7orf71	A4D174	169 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	FXYD1	O00168	92 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFRSF11B	O00300	401 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF861P	O60384	105 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	RND2	P52198	227 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	GAGE2B	Q13066	116 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	OPCML	Q14982	345 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	PPCS	Q9HAB8	311 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		3.2	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	GAGE12J	A6NER3	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSCAN12	O43309	604 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	MPDU1	O75352	247 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	CBX5	P45973	191 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	NHLH2	Q02577	135 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	GAGE1	Q13065	139 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	GAGE4	Q13068	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	GAGE5	Q13069	117 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	FLOT2	Q14254	428 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35G3	Q8N808	338 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A22	Q9H936	323 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	COMMD9	Q9P000	198 aa		3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087WWL8	130 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM212	A6NML5	194 aa		3.18	□□□□□ -1.9

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