RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	SSNA1	O43805	119 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	MPC2	O95563	127 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	9.85	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	AMTN	Q6UX39	209 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	C20orf173	Q96LM9	149 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	C17orf77	Q96MU5	243 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		9.85	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	OR2F1	Q13607	317 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	AKAP14	Q86UN6	197 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	GGACT	Q9BVM4	153 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	RPRM	Q9NS64	109 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	DOK5	Q9P104	306 aa		9.84	□□□□□ -0.83
MUC1-222	ENST00000610468	GALR1	P47211	349 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	SULT1A1	P50225	295 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	S100A10	P60903	97 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	RRN3P1	Q2M238	152 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		9.83	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF98	A6NK75	572 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	CST7	O76096	145 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	HTN3	P15516	51 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	NHLH2	Q02577	135 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	C16orf92	Q96LL3	132 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		9.82	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468		E5RGE8	158 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	LINC00869	P0C866	280 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	CAV2	P51636	162 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	PLP1	P60201	277 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	DAD1	P61803	113 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	MGST2	Q99735	147 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	RSG1	Q9BU20	258 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	MED28	Q9H204	178 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		9.81	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	LYRM9	A8MSI8	78 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468		L7N2F9	121 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	TSPO	P30536	169 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	VAMP2	P63027	116 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	PATE2	Q6UY27	113 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF575	Q86XF7	245 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	GPR82	Q96P67	336 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	SLC25A22	Q9H936	323 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	MBD2	Q9UBB5	411 aa		9.8	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	9.79	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	INS	P01308	110 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	9.79	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	ASB13	Q8WXK3	278 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	WFDC1	Q9HC57	220 aa		9.79	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		9.78	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468		M0R2Z0	102 aa		9.78	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	ORM2	P19652	201 aa		9.78	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	S100A7	P31151	101 aa		9.78	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	S100A11	P31949	105 aa		9.78	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	B2M	P61769	119 aa		9.78	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		9.78	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		9.78	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	HSPG2	P98160	4391 aa		9.77	□□□□□ -0.84
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468		H3BRN7	92 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	AGPAT2	O15120	278 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	RLN2	P04090	185 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	PRM2	P04554	102 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	RAP2B	P61225	183 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	TEPP	Q6URK8	271 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	OR5C1	Q8NGR4	320 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	HSPB11	Q9Y547	144 aa		9.77	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	RNF222	A6NCQ9	220 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	9.76	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	9.76	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	AKR1C1	Q04828	323 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	BAX	Q07812	192 aa		9.76	□□□□□ -0.85
MUC1-222	ENST00000610468	OPCML	Q14982	345 aa		9.76	□□□□□ -0.85

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