RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602698.5

HCG18-247, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 573 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-247ENST00000602698 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-247ENST00000602698 PATE2Q6UY27 113 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-247ENST00000602698 S100A7AQ86SG5 101 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-247ENST00000602698 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-247ENST00000602698 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-247ENST00000602698 ARL6Q9H0F7 186 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-247ENST00000602698 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-247ENST00000602698 ARV1Q9H2C2 271 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-247ENST00000602698 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.78□□□□□ -1.32
HCG18-247ENST00000602698 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 C7orf66A4D0T2 115 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 LYRM9A8MSI8 78 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 CCSO14618 274 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 AGPAT2O15120 278 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 RTL8CO15255 209 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PRM2P04554 102 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 CXCL2P19875 107 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 TSPOP30536 169 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PSG3Q16557 428 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 ZNF546Q86UE3 836 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 GGACTQ9BVM4 153 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 RNF24Q9Y225 148 aa6.77□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 MUC4Q99102 2169 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 GOSR2O14653 212 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PLA2G10O15496 165 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 LYRM1O43325 122 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 RHOBP62745 196 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 RNF212Q495C1 297 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 LCN15Q6UWW0 184 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 TMEM256Q8N2U0 113 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 MGST2Q99735 147 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 L7N2F9 121 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 AZU1P20160 251 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 VAMP2P63027 116 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 ZNF846Q147U1 533 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 Q6ZR54 194 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.75□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 FAM25EA8MYX2 175 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 SLC17A3O00476 420 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 COX7A2P2O60397 106 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 TCRBP04435 133 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 DEFB130BP0DP73 79 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 DEFB130AP0DP74 79 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 CDKN1BP46527 198 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 TAS2R60P59551 318 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 OPCMLQ14982 345 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 MORN5Q5VZ52 161 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 C16orf74Q96GX8 76 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 LINC01587Q99440 93 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 NUDT15Q9NV35 164 aa6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 C5orf51A6NDU8 294 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 CST7O76096 145 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 IGLC2P0DOY2 106 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 CAMLGP49069 296 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 BCAP31P51572 246 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 CAV2P51636 162 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 FCN2Q15485 313 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 RYR1P21817 5038 aa6.73□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 PRAC2D3DTV9 90 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 F5H768 121 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 H3BTX0 84 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 H7BYZ3 331 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 ATP5G1P05496 136 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 HTN1P15515 57 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 ATP5G3P48201 142 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 RAB31Q13636 194 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 KIR3DS1Q14943 382 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 VWC2Q2TAL6 325 aa6.72□□□□□ -1.33
HCG18-247ENST00000602698 MIC13Q5XKP0 118 aa6.72□□□□□ -1.33
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