RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	PSG3	Q16557	428 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	MORN5	Q5VZ52	161 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	LCN15	Q6UWW0	184 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	NEU1	Q99519	415 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	MFF	Q9GZY8	342 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	HRH4	Q9H3N8	390 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	RYR2	Q92736	4967 aa		10.11	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	CXorf65	A6NEN9	183 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	NUPR2	A6NF83	97 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	IGKV3-20	P01619	116 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	IGLC2	P0DOY2	106 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	AMTN	Q6UX39	209 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	RNF182	Q8N6D2	247 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	DEFB4A	O15263	64 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	HSPB11	Q9Y547	144 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GGA3-215	ENST00000582821	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF253	O75346	499 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	AMBP	P02760	352 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	FXYD7	P58549	80 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	PMS2P11	Q13670	270 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	CLINT1	Q14677	625 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	GUK1	Q16774	197 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF738	Q8NE65	137 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	THAP6	Q8TBB0	222 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	MBD2	Q9UBB5	411 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821		H3BQ15	152 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	JTB	O76095	146 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	HLA-DMB	P28068	263 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	ATP5S	Q99766	215 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	MED28	Q9H204	178 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	FCN2	Q15485	313 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	ASB13	Q8WXK3	278 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.06	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	SLC17A3	O00476	420 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		10.05	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	C11orf94	C9JXX5	98 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	IFNA5	P01569	189 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	PDE6H	Q13956	83 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	RGS21	Q2M5E4	152 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	RFNG	Q9Y644	331 aa		10.04	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821		H3BTX0	84 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	OXA1L	Q15070	435 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	WFDC1	Q9HC57	220 aa		10.03	□□□□□ -0.8
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-215	ENST00000582821		M0R2Z0	102 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-215	ENST00000582821	NDUFB4	O95168	129 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-215	ENST00000582821	INS	P01308	110 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-215	ENST00000582821	HBE1	P02100	147 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-215	ENST00000582821	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-215	ENST00000582821	TCTA	P57738	103 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-215	ENST00000582821	RHOB	P62745	196 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-215	ENST00000582821	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		10.02	□□□□□ -0.81
GGA3-215	ENST00000582821	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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