RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567147.5

RNPS1-222, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3 BASIC

Gene RNPS1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM189	A5PLL7	270 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	CXCL3	P19876	107 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	S100A10	P60903	97 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF738	Q8NE65	137 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		12.52	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	COX7A2P2	O60397	106 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	UPK1B	O75841	260 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	CAMLG	P49069	296 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB31	Q13636	194 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	RAB32	Q13637	225 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	ENKUR	Q8TC29	256 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		12.51	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	HBE1	P02100	147 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	SULT1A1	P50225	295 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	IFITM3	Q01628	133 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	PSG3	Q16557	428 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	RNF126	Q9BV68	326 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	IGSF23	A1L1A6	192 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147		M0R2Z0	102 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	AMBP	P02760	352 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	MED14OS	P0DP75	135 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	S100A11	P31949	105 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	VWC2	Q2TAL6	325 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	MORN5	Q5VZ52	161 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	MIC13	Q5XKP0	118 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147		Q6ZRG5	221 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	DKK2	Q9UBU2	259 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		12.49	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147		A0A1B0GVY2	172 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	RRN3P1	Q2M238	152 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	SIX6	O95475	246 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	PRM2	P04554	102 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	RHOB	P62745	196 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	HBG1	P69891	147 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	HBG2	P69892	147 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	OPCML	Q14982	345 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	STX12	Q86Y82	276 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	PKD1	P98161	4303 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147		H3BTX0	84 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	INS	P01308	110 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	CXCL2	P19875	107 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	BAX	Q07812	192 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	LCN15	Q6UWW0	184 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		12.46	□□□□□ -0.41
RNPS1-222	ENST00000567147	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147		H3BQ15	152 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	IGLC2	P0DOY2	106 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	ATP6V1F	Q16864	119 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	BAP18	Q8IXM2	172 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	RLN2	P04090	185 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	FGF7	P21781	194 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	B2M	P61769	119 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	NHLH2	Q02577	135 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	PFDN5	Q99471	154 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		12.44	□□□□□ -0.42
RNPS1-222	ENST00000567147	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		12.44	□□□□□ -0.42

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