RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	S100A10	P60903	97 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR20E	P86478	221 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR20C	P86479	221 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR20D	P86480	221 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR20B	P86481	221 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR20A	P86496	221 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	MORN5	Q5VZ52	161 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		15.57	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	EMP1	P54849	157 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF738	Q8NE65	137 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ENKUR	Q8TC29	256 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF126	Q9BV68	326 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		15.56	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	COX7A2P2	O60397	106 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CXCL2	P19875	107 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	S100A11	P31949	105 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	PSG3	Q16557	428 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	DKK2	Q9UBU2	259 aa		15.55	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200		M0R2Z0	102 aa		15.54	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	AMBP	P02760	352 aa		15.54	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RAB31	Q13636	194 aa		15.54	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	OPCML	Q14982	345 aa		15.54	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		15.54	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	MIC13	Q5XKP0	118 aa		15.54	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	15.54	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAH2	Q9P225	4427 aa		15.54	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	HBE1	P02100	147 aa		15.53	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		15.53	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LCN15	Q6UWW0	184 aa		15.53	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		15.53	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		15.53	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	15.53	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		15.53	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	IGLC2	P0DOY2	106 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	RRN3P1	Q2M238	152 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200		Q6ZRG5	221 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	STX12	Q86Y82	276 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		15.52	■□□□□ 0.08
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	HBG1	P69891	147 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	HBG2	P69892	147 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BQ15	152 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC17A3	O00476	420 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SIX6	O95475	246 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	INS	P01308	110 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	BAP18	Q8IXM2	172 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	NMES1	Q9C002	83 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		15.51	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAF2	O60831	178 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	BAX	Q07812	192 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	OXA1L	Q15070	435 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP6V1F	Q16864	119 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		15.5	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PRM2	P04554	102 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	B2M	P61769	119 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PFDN5	Q99471	154 aa		15.49	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200		H3BTX0	84 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	NHLH2	Q02577	135 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		15.48	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YIZ8	118 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	MPDU1	O75352	247 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TSPO	P30536	169 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	RHOB	P62745	196 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		15.47	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAC2	D3DTV9	90 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200		E5RGE8	158 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	FGF7	P21781	194 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	H2BFS	P57053	126 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		15.46	■□□□□ 0.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		15.45	■□□□□ 0.06
PPP4C-205	ENST00000563200	GUK1	Q16774	197 aa		15.45	■□□□□ 0.06

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