RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556705.5

SRP54-AS1-204, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SRP54-AS1, Length 580 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CXCL3P19876 107 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CNN1P51911 297 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C1orf158Q8N1D5 194 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF738Q8NE65 137 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NEU1Q99519 415 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 KMT2AQ03164 3969 aa9.52□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 H0YIZ8 118 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DEFA1P59665 94 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DEFA3P59666 94 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HBG1P69891 147 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HBG2P69892 147 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NHLH2Q02577 135 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RAB31Q13636 194 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OPCMLQ14982 345 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PSG3Q16557 428 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ATP6V1FQ16864 119 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 Q6ZTC4 211 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF767PQ75MW2 155 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 STX12Q86Y82 276 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LRRC20Q8TCA0 184 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NMES1Q9C002 83 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR5AC2Q9NZP5 309 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RNF24Q9Y225 148 aa9.51□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRAV5A0A0B4J249 113 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SMIM9A6NGZ8 99 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C11orf94C9JXX5 98 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 H3BTX0 84 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RLN2P04090 185 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 FGF7P21781 194 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 H2BFSP57053 126 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BAXQ07812 192 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C12orf74Q32Q52 190 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 Q6ZRG5 221 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C2CD4CQ8TF44 421 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.5□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 E5RGE8 158 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 M0R2Z0 102 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 B2MP61769 119 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CYCSP99999 105 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC39A9Q9NUM3 307 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.49□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRAV10A0A0B4J240 114 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGLL5B9A064 214 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 H3BQ15 152 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC17A3O00476 420 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 IGLC2P0DOY2 106 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CXCL2P19875 107 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 EMP1P54849 157 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LCE2CQ5TA81 110 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LCN15Q6UWW0 184 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 OR1L4Q8NGR5 311 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RNF126Q9BV68 326 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC25A31Q9H0C2 315 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 APLNQ9ULZ1 77 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RFNGQ9Y644 331 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.48□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SSNA1O43805 119 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 AMBPP02760 352 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRM2P04554 102 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 RHOBP62745 196 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LGALS9CQ6DKI2 356 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BAP18Q8IXM2 172 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 THAP6Q8TBB0 222 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PFDN5Q99471 154 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.47□□□□□ -0.89
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.46□□□□□ -0.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.46□□□□□ -0.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TMEM189A5PLL7 270 aa9.46□□□□□ -0.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 PRAC2D3DTV9 90 aa9.46□□□□□ -0.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.46□□□□□ -0.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 MPDU1O75352 247 aa9.46□□□□□ -0.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 HBE1P02100 147 aa9.46□□□□□ -0.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 SPART-AS1P0CW21 52 aa9.46□□□□□ -0.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 TCTAP57738 103 aa9.46□□□□□ -0.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 CLINT1Q14677 625 aa9.46□□□□□ -0.9
SRP54-AS1-204ENST00000556705 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms