RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	OPCML	Q14982	345 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		Q6ZTC4	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ARV1	Q9H2C2	271 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ZNF98	A6NK75	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	KNCN	A6PVL3	124 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		H3BRN7	92 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		J3QL48	77 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RTL8C	O15255	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	BUB3	O43684	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	B2M	P61769	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	FAM210B	Q96KR6	192 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		U3KQE9	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		X6R8D5	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	FNDC10	F2Z333	226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	IFNA5	P01569	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RAB31	Q13636	194 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ATP6V1F	Q16864	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	C12orf74	Q32Q52	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	PSMG4	Q5JS54	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		Q6ZRG5	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	LINC00052	Q96N35	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	AQP10	Q96PS8	301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	TMEM189	A5PLL7	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	HELT	A6NFD8	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		F6UB75	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		K7EQG2	157 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		M0R2N4	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	IGKV3-20	P01619	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	PYY	P10082	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	CXCL2	P19875	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RAB2A	P61019	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SELENOT	P62341	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RNF212	Q495C1	297 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	FAM78B	Q5VT40	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		Q6ZR54	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	AKAP14	Q86UN6	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	NRN1	Q9NPD7	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SLC17A3	O00476	420 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	OR10J4	P0C629	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	C4BPB	P20851	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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