RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.89□□□□□ -0.67
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SH3BP2-215ENST00000510074 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP10.88□□□□□ -0.67
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SH3BP2-215ENST00000510074 SYNGR2O43760 224 aa10.83□□□□□ -0.68
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SH3BP2-215ENST00000510074 MYCBP2O75592 4640 aa10.83□□□□□ -0.68
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SH3BP2-215ENST00000510074 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa10.81□□□□□ -0.68
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SH3BP2-215ENST00000510074 MSRB1Q9NZV6 116 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-215ENST00000510074 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-215ENST00000510074 RABL2BQ9UNT1 228 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-215ENST00000510074 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-215ENST00000510074 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.77□□□□□ -0.69
SH3BP2-215ENST00000510074 CT45A10P0DMU9 189 aa10.77□□□□□ -0.69
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SH3BP2-215ENST00000510074 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa10.77□□□□□ -0.69
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