RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NACAE9PAV3 2078 aa13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPBPP02775 128 aa13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAA4P35542 130 aa13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A0U1RRA0 63 aa13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAX1P15863 534 aa13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACTL10Q5JWF8 245 aa13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEGF9Q9H1U4 602 aa13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VCX2Q9H322 139 aa13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 hDV102S1A0JD36 115 aa13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF138Q8WVD3 245 aa13.4□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMKR1H3BMG3 65 aa13.4□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM14BQ9NUH8 114 aa13.4□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CEP295Q9C0D2 2601 aa13.4□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.4□□□□□ -0.267e-7■■■■□ 25.1
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 COL4A3Q01955 1670 aa13.4□□□□□ -0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PTPRSQ13332 1948 aa13.4□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASPHD1Q5U4P2 390 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLXNB1O43157 2135 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HAPLN4Q86UW8 402 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DPM2O94777 84 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM155Q4W5P6 130 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MINOS1Q5TGZ0 78 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM215AQ9Y5M1 114 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TLN2Q9Y4G6 2542 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV3-1P01715 115 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRTN3P24158 256 aa13.39□□□□□ -0.27
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AMN1Q8IY45 258 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TPSG1Q9NRR2 321 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYSLTR1Q9Y271 337 aa13.39□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FCN3O75636 299 aa13.38□□□□□ -0.27
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C3orf36Q3SXR2 165 aa13.38□□□□□ -0.27
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa13.38□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa13.38□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 F2Z2F3 143 aa13.38□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF664Q8N3J9 261 aa13.38□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH2D1AO60880 128 aa13.38□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DKK1O94907 266 aa13.38□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.37□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STHQ8IWL8 128 aa13.37□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MSRB2Q9Y3D2 182 aa13.37□□□□□ -0.27
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa13.36□□□□□ -0.27
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARMS2P0C7Q2 107 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGFL3Q6UXB1 125 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM101Q96IK0 257 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 G3V318 75 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C15orf65H3BRN8 121 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERCC8Q13216 396 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IL15RAQ13261 267 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSG3Q16557 428 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa13.36□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B4DSR2 109 aa13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 K7ENP7 123 aa13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OVOL1O14753 267 aa13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LY96Q9Y6Y9 160 aa13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDH15Q96QU1 1955 aa13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GGTLC3B5MD39 225 aa13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OVOL3O00110 214 aa13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRSS33Q8NF86 280 aa13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa13.34□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM8BA6NDV4 472 aa13.34□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ITGB1BP1O14713 200 aa13.34□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GATA4P43694 442 aa13.34□□□□□ -0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EML6Q6ZMW3 1958 aa13.34□□□□□ -0.27
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