RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		6.15	□□□□□ -1.42
USP34-208	ENST00000467128	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	6.15	□□□□□ -1.42
USP34-208	ENST00000467128	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		6.15	□□□□□ -1.42
USP34-208	ENST00000467128	CSTL1	Q9H114	145 aa		6.15	□□□□□ -1.42
USP34-208	ENST00000467128	MBD2	Q9UBB5	411 aa		6.15	□□□□□ -1.42
USP34-208	ENST00000467128	HSPB11	Q9Y547	144 aa		6.15	□□□□□ -1.42
USP34-208	ENST00000467128	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		6.15	□□□□□ -1.42
USP34-208	ENST00000467128	C3orf84	H3BNL1	204 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	FGF7	P21781	194 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	NHLH2	Q02577	135 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	LEMD1	Q68G75	181 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	LCN15	Q6UWW0	184 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	PATE2	Q6UY27	113 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	THAP6	Q8TBB0	222 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	UHRF2	Q96PU4	802 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	ATP5S	Q99766	215 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	SLC25A22	Q9H936	323 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	RPRM	Q9NS64	109 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	DOK5	Q9P104	306 aa		6.14	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128		A8MTW9	85 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	SPRY2	O43597	315 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	ZNF253	O75346	499 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	FCN2	Q15485	313 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	GUK1	Q16774	197 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	DEFB135	Q30KP9	77 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	MIC13	Q5XKP0	118 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	IL17D	Q8TAD2	202 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	MUC7	Q8TAX7	377 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	C17orf77	Q96MU5	243 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	AQP10	Q96PS8	301 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	HRH4	Q9H3N8	390 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		6.13	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128		H3BMM0	161 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	IGLC2	P0DOY2	106 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	PDE6H	Q13956	83 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	ZNF266	Q14584	549 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	CLINT1	Q14677	625 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	ZNF709	Q8N972	641 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	C16orf92	Q96LL3	132 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	RSG1	Q9BU20	258 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		6.12	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128		A0A0J9YX75	114 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	IFNA5	P01569	189 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	RETN	Q9HD89	108 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	6.11	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		6.11	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	KNCN	A6PVL3	124 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	AMBP	P02760	352 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	C4BPB	P20851	252 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	MORN5	Q5VZ52	161 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	LINC00052	Q96N35	136 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	AGRN	O00468	2067 aa		6.1	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	MIF	P14174	115 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	PSG3	Q16557	428 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	CASC10	Q5T4H9	136 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	FAM78B	Q5VT40	261 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	NEU1	Q99519	415 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	RARRES2	Q99969	163 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		6.09	□□□□□ -1.43
USP34-208	ENST00000467128	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		6.08	□□□□□ -1.44

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