RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436282.1

TOP3B-206, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 2,890 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM75Q8N9X5 138 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 RABAC1Q9UI14 185 aa11.85□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 Q6AWC8 147 aa11.84□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 Q8NA96 180 aa11.84□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 A0A096LNJ9 63 aa11.84□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 SAP30O75446 220 aa11.84□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 LYPD2Q6UXB3 125 aa11.84□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.84□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.84□□□□□ -0.51
TOP3B-206ENST00000436282 ENSAO43768 121 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 APELAP0DMC3 54 aa11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 LGALS9BQ3B8N2 356 aa11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 LGALS9CQ6DKI2 356 aa11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PIP4P2Q8N4L2 257 aa11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 JMJD8Q96S16 334 aa11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PPIAL4EA0A075B759 164 aa11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PPIAL4FP0DN26 164 aa11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 NHLH1Q02575 133 aa11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ZNF493Q6ZR52 646 aa11.83□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 FAM106CPP0CH98 169 aa11.82□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 HSD52Q0P140 79 aa11.82□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 FAM106AQ4KMX7 169 aa11.82□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 K7EP34 96 aa11.82□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 OR9G4Q8NGQ1 327 aa11.82□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.82□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 KALRNO60229 2985 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PSG8Q9UQ74 426 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 H3BUT2 72 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 K7EQM0 130 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 SIVA1O15304 175 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 NGBQ9NPG2 151 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ABCA4P78363 2273 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 A1L4Q6 167 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM178BH3BS89 294 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 NDUFB3O43676 98 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 CRYGBP07316 175 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 KIR3DS1Q14943 382 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TPPP3Q9BW30 176 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 SCNM1Q9BWG6 230 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 U3KQK5 164 aa11.81□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 D6R8Y8 96 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 NBL1P41271 181 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 CRIP1P50238 77 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 RBPJQ06330 500 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PSG3Q16557 428 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 A0A0G2JLM5 398 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 G3V4G9 280 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 DLX6P56179 175 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 OR4X2Q8NGF9 303 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ASCL2Q99929 193 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 RASL11BQ9BPW5 248 aa11.8□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 CNTFRP26992 372 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 S100A7P31151 101 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 RIPPLY3P57055 190 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 CACNG7P62955 275 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ASCL5Q7RTU5 278 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 THYN1Q9P016 225 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 SIGLEC9Q9Y336 463 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TEX22C9J3V5 150 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 PRELID3AQ96N28 172 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 HILPDAQ9Y5L2 63 aa11.79□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 VSTM5A8MXK1 200 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 DLX1P56177 255 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 C17orf77Q96MU5 243 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM238C9JI98 176 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 HBDP02042 147 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 RBP4P02753 201 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 LOXP28300 417 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 ORMDL3Q8N138 153 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM133Q9H2Q1 129 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 CTSZQ9UBR2 303 aa11.78□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 E7EQL1 145 aa11.77□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 H3BRN7 92 aa11.77□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 I3L2K1 104 aa11.77□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 IGHV1-8P0DP01 117 aa11.77□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TMEM155Q4W5P6 130 aa11.77□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.77□□□□□ -0.52
TOP3B-206ENST00000436282 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
TOP3B-206ENST00000436282 IGKV1-17P01599 117 aa11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms