RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253754.7

PDLIM4-201, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 2,282 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-201ENST00000253754 UBE2E1P51965 193 aa14.64□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 TPPP2P59282 170 aa14.64□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.64□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.64□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 IQCJQ1A5X6 159 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 SMIM12Q96EX1 92 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 COX19Q49B96 90 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 GTSF1Q8WW33 167 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 PRSS22Q9GZN4 317 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 RNF114Q9Y508 228 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.63□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 NDUFS8O00217 210 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF253O75346 499 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 P01737 135 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM106CPP0CH98 169 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 PIP4P2Q8N4L2 257 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 NAGKQ9UJ70 344 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 M0R3E3 92 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa14.61□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 KRTAP10-9P60411 292 aa14.61□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 PAFAH1B2P68402 229 aa14.61□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ECSCRQ19T08 205 aa14.61□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 CHRDL1Q9BU40 450 aa14.61□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.61□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 OR10J3Q5JRS4 329 aa14.61□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.61□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 CCDC168Q8NDH2 2452 aa14.6□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF785A8K8V0 405 aa14.6□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 TCAPO15273 167 aa14.6□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 BRS3P32247 399 aa14.6□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.6□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 TMUB1Q9BVT8 246 aa14.6□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF492Q9P255 531 aa14.6□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 NOTCH2Q04721 2471 aa14.6□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 LINC01548A6NM66 108 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 A0A1B0GXF2 115 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 A0A1W2PS18 150 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 A8MWP6 167 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP6V0E1O15342 81 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 CTSGP08311 255 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 PMCHP20382 165 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 RASL11AQ6T310 242 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 KCNS1Q96KK3 526 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 THYN1Q9P016 225 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-201ENST00000253754 GPX1P07203 203 aa14.58□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 NPFFO15130 113 aa14.58□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa14.58□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 TOMM20LQ6UXN7 152 aa14.58□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.58□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 C18orf32Q8TCD1 76 aa14.58□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa14.58□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 C1RLQ9NZP8 487 aa14.58□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 ZANQ9Y493 2812 aa14.57□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa14.57□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 A8MWL6 223 aa14.57□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 AMTP48728 403 aa14.57□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 TDRG1Q3Y452 100 aa14.57□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.57□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 G3V318 75 aa14.57□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 DIRC3C9JPN6 131 aa14.56□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 GPR183P32249 361 aa14.56□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 C15orf32Q32M92 178 aa14.56□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 CT83Q5H943 113 aa14.56□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 TMEM219Q86XT9 240 aa14.56□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 TMEM75Q8N9X5 138 aa14.56□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 PSG8Q9UQ74 426 aa14.56□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 RNF24Q9Y225 148 aa14.56□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.55□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 HBBP68871 147 aa14.55□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa14.55□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 KRTDAPP60985 99 aa14.55□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 PSG3Q16557 428 aa14.55□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.55□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 LYPD1Q8N2G4 141 aa14.55□□□□□ -0.08
PDLIM4-201ENST00000253754 NRN1Q9NPD7 142 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms