RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639850.1

ME2-216, Transcript of malic enzyme 2, human

TSL 5 BASIC

Gene ME2, Length 2,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ME2-216	ENST00000639850	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		16.03	■□□□□ 0.16
ME2-216	ENST00000639850	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		16.03	■□□□□ 0.16
ME2-216	ENST00000639850	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
ME2-216	ENST00000639850	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
ME2-216	ENST00000639850	C17orf77	Q96MU5	243 aa		16.03	■□□□□ 0.16
ME2-216	ENST00000639850	GPR82	Q96P67	336 aa		16.03	■□□□□ 0.16
ME2-216	ENST00000639850	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		16.03	■□□□□ 0.16
ME2-216	ENST00000639850	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		16.02	■□□□□ 0.16
ME2-216	ENST00000639850	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		16.02	■□□□□ 0.16
ME2-216	ENST00000639850	SMIM12	Q96EX1	92 aa		16.02	■□□□□ 0.16
ME2-216	ENST00000639850	XKRY2	A2RUG3	117 aa		16.02	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	16.02	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	S100A2	P29034	98 aa		16.02	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	ADM	P35318	185 aa		16.02	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	PRR27	Q6MZM9	219 aa		16.02	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		16.02	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	16.02	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	16.02	■□□□□ 0.15	4e-9	■■■■□ 21.9
ME2-216	ENST00000639850	AMY1A	P04745	511 aa		16.01	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	GPR183	P32249	361 aa		16.01	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	TCL1A	P56279	114 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	NUDT11	Q96G61	164 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	MS4A10	Q96PG2	267 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	LTA	P01374	205 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	CLEC3B	P05452	202 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	LY6E	Q16553	131 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	RABAC1	Q9UI14	185 aa		16	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850		H3BUX3	64 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	CBLN1	P23435	193 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	GATA3	P23771	443 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	MLST8	Q9BVC4	326 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	SPINK4	O60575	86 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	AVP	P01185	164 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	IER3	P46695	156 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		15.99	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		15.98	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	15.98	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	CENPE	Q02224	2701 aa		15.98	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	BMPR1B	O00238	502 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	SLC35B1	P78383	322 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	FABP4	P15090	132 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	PDE6H	Q13956	83 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	GNB4	Q9HAV0	340 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	FBN2	P35556	2912 aa		15.97	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	S100A7	P31151	101 aa		15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	OR10D4P	Q8NGN7	298 aa		15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	MBD6	Q96DN6	1003 aa		15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	CCDC140	Q96MF4	163 aa		15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850		A6NDX4	124 aa		15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850		Q86TA4	180 aa		15.96	■□□□□ 0.15
ME2-216	ENST00000639850	SNURFL	B1AK76	121 aa		15.95	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		15.95	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	PRNT	Q86SH4	94 aa		15.95	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		15.95	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	AAMDC	Q9H7C9	122 aa		15.95	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		15.95	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	IGLV2-11	P01706	119 aa		15.95	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	ATP5G2	Q06055	141 aa		15.95	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850		A0A096LNT2	108 aa		15.94	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850		K7EQM0	130 aa		15.94	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	POLQ	O75417	2590 aa		15.94	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	COL8A1	P27658	744 aa		15.94	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		15.94	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	WDR73	Q6P4I2	378 aa		15.94	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	ZFAND3	Q9H8U3	227 aa		15.94	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850		M0QZK8	103 aa		15.93	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	PSG9	Q00887	426 aa		15.93	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	COX19	Q49B96	90 aa		15.93	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	15.93	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	15.93	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		15.93	■□□□□ 0.14
ME2-216	ENST00000639850	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		15.93	■□□□□ 0.14

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms