RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM262E9PQX1 116 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 PAX9P55771 341 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 BEND2Q8NDZ0 799 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 OVOL1O14753 267 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 STHQ8IWL8 128 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM14BQ9NUH8 114 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TRGV2A0A075B6R0 118 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 K7EM74 188 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00614P0C842 121 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 JMJD8Q96S16 334 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 FNDC10F2Z333 226 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TDGF1P13385 188 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 LEPP41159 167 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 MST1LQ2TV78 715 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 OR10J3Q5JRS4 329 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 K7ERU9 68 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 MMP23AO75900 390 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 PPBPP02775 128 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 ADCYAP1P18509 176 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 OR5AN1Q8NGI8 311 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 C15orf65H3BRN8 121 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF688P0C7X2 276 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 Q8TAT8 98 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 HIST1H2BLQ99880 126 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 C9JQL5 133 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 PRR31Q5SQ13 230 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A16P16260 332 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TCF15Q12870 199 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 IGFL4Q6B9Z1 124 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 F2Z2F3 143 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF134P52741 427 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 TEX36Q5VZQ5 186 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2CO00762 179 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 PTPN13Q12923 2485 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 EVI2AP22794 236 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2E1P51965 193 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa16.71■□□□□ 0.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00479Q96M42 142 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRJ-208ENST00000615445 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa16.71■□□□□ 0.27
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PTPRJ-208ENST00000615445 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.69■□□□□ 0.26
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PTPRJ-208ENST00000615445 JKAMPQ9P055 326 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 RNF223E7ERA6 249 aa16.68■□□□□ 0.26
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PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM190Q8WZ59 177 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM8BA6NDV4 472 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 LYPD1Q8N2G4 141 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 SLX1AQ9BQ83 275 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 AMBPP02760 352 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP6V0E1O15342 81 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 CYB5R2Q6BCY4 276 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRJ-208ENST00000615445 MRAP2Q96G30 205 aa16.67■□□□□ 0.26
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