RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 OR10G9Q8NGN4 311 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 OR10G7Q8NGN6 311 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 LINC01006Q8NI28 216 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 TMED6Q8WW62 240 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM158Q8WZ71 300 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 MS4A10Q96PG2 267 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 DUX5Q96PT3 197 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 METTL26Q96S19 204 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 WFDC1Q9HC57 220 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CLEC5AQ9NY25 188 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 PEMTQ9UBM1 199 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 RABAC1Q9UI14 185 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.68□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 OR2T8A6NH00 312 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 SEC14L6B5MCN3 397 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 LGALS9O00182 355 aa5.67□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 CXorf1O96002 111 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CTSGP08311 255 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 NPPCP23582 126 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 PSMB3P49720 205 aa5.67□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 RPEL1Q2QD12 228 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 KHDC3LQ587J8 217 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CLLU1Q5K131 121 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF329Q86UD4 541 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 NDUFA11Q86Y39 141 aa5.67□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 GLMPQ8WWB7 406 aa5.67□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 GNB4Q9HAV0 340 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.67□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 HELTA6NFD8 242 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 YIF1AO95070 293 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1-17P01599 117 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 OR5G3P0C626 314 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 PSG1P11464 419 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 GPR183P32249 361 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 PROK1P58294 105 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 ALKAL2Q6UX46 152 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 IL34Q6ZMJ4 242 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 OR4F4Q96R69 305 aa5.66□□□□□ -1.5
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SMAD4-210ENST00000590061 FUT9Q9Y231 359 aa5.66□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 LINC01619G3V211 115 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 IL4P05112 153 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 C8orf88P0DMB2 117 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 ORM2P19652 201 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 GALR1P47211 349 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 LYZP61626 148 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 TIGITQ495A1 244 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 FAM74A1Q5RGS3 127 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 FAM78BQ5VT40 261 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 OR1B1Q8NGR6 318 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 KLK15Q9H2R5 256 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 MANBALQ9NQG1 85 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 RPRMQ9NS64 109 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.65□□□□□ -1.5
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 RAB19A4D1S5 217 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 F6UZH7 168 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 F8WDY8 70 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 MYCNOSP40205 109 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 PAFAH1B2P68402 229 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF90Q03938 601 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 PDE6HQ13956 83 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 PEA15Q15121 130 aa5.64□□□□□ -1.51
SMAD4-210ENST00000590061 MIC13Q5XKP0 118 aa5.64□□□□□ -1.51
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