RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574322.5

CTDNEP1-210, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-210ENST00000574322 PGPEP1LA6NFU8 196 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 H7BYZ3 331 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 PPP1R2P9O14990 202 aa22.06■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 PEX7O00628 323 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 TGOLN2O43493 480 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 Q6ZS46 218 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 EPDR1Q9UM22 224 aa22.05■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 TRGV3P03979 118 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 GNG4P50150 75 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 CFHR3Q02985 330 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 CLEC19AQ6UXS0 136 aa22.04■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR4F17Q8NGA8 305 aa22.04■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa22.04■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 BMPR1BO00238 502 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 IGLV1-40P01703 118 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 Q9H3A6 140 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 ZFAND3Q9H8U3 227 aa22.03■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 OTORQ9NRC9 128 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 TEX29Q8N6K0 151 aa22.03■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 CXCL1P09341 107 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 TEX38Q6PEX7 206 aa22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CTDNEP1-210ENST00000574322 KLF12Q9Y4X4 402 aa22.02■■□□□ 1.12
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CTDNEP1-210ENST00000574322 C1QL4Q86Z23 238 aa22■■□□□ 1.11
CTDNEP1-210ENST00000574322 OR5B12Q96R08 314 aa22■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-210ENST00000574322 IGLV2-8P01709 118 aa22■■□□□ 1.11
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CTDNEP1-210ENST00000574322 FMC1Q96HJ9 113 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 OSTCQ9NRP0 149 aa21.93■■□□□ 1.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 INAFM1C9JVW0 142 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 BUB3O43684 328 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 RPS10P46783 165 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 C1orf194Q5T5A4 169 aa21.92■■□□□ 1.1
CTDNEP1-210ENST00000574322 KCNIP4Q6PIL6 250 aa21.92■■□□□ 1.1
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