RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	METTL26	Q96S19	204 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	MGST2	Q99735	147 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	SLC25A22	Q9H936	323 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GVG6	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	AGPAT2	O15120	278 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	OR5G3	P0C626	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	LINC00869	P0C866	280 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688		P0DMU3	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	FAM231A	P0DMU4	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	FAM231C	P0DMU5	169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	NPPC	P23582	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	P2RY1	P47900	373 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	ZNF124	Q15973	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	STXBP6	Q8NFX7	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	TRGV9	Q99603	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	WFDC1	Q9HC57	220 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	RABAC1	Q9UI14	185 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688		G3V3Q6	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688		H3BTX0	84 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	DEFB4A	O15263	64 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	ARPC5	O15511	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	PET100	P0DJ07	73 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	SPP1	P10451	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	HLA-DMB	P28068	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	STH	Q8IWL8	128 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688		Q8NAQ8	132 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	ARL6	Q9H0F7	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	HSPB11	Q9Y547	144 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CS-233	ENST00000552688	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PS18	150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		J3KRW8	73 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	AMBP	P02760	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	FABP1	P07148	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	CRYBB3	P26998	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	S100A11	P31949	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	CAMLG	P49069	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	DEFB131A	P59861	70 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	DEFB1	P60022	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RAP2B	P61225	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	HBG1	P69891	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	HBG2	P69892	147 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	TNP2	Q05952	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	CD300C	Q08708	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	FGL1	Q08830	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	MORN5	Q5VZ52	161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688		Q6ZNX1	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ATP5S	Q99766	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RSG1	Q9BU20	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	PXMP4	Q9Y6I8	212 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	COX7A2P2	O60397	106 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	HYPM	O75409	117 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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