RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 IFNA5P01569 189 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 PSMG4Q5JS54 123 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF709Q8N972 641 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM37Q8WXS4 190 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 GPR82Q96P67 336 aa14.67□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 AQP10Q96PS8 301 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 PFDN5Q99471 154 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 RSG1Q9BU20 258 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 WFDC1Q9HC57 220 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.66□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 SMLR1H3BR10 107 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 RPL7P18124 248 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 MORN5Q5VZ52 161 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 ZMAT4Q9H898 229 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.65□□□□□ -0.06
HLA-B-255ENST00000498007 G3V3Q6 166 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 LINC00052Q96N35 136 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 RNF24Q9Y225 148 aa14.64□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 KNCNA6PVL3 124 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 SOCS3O14543 225 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 ID1P41134 155 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 PSMB3P49720 205 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 MEOX2P50222 304 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 C16orf92Q96LL3 132 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 RETNQ9HD89 108 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 TNFSF18Q9UNG2 199 aa14.63□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 RNF222A6NCQ9 220 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 APOC4P55056 127 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 STHQ8IWL8 128 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 C17orf77Q96MU5 243 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 SPATA25Q9BR10 227 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 U3KQK5 164 aa14.62□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 ISLRO14498 428 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 SAMD13Q5VXD3 122 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 RCHY1Q96PM5 261 aa14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 ARPC5O15511 151 aa14.6□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 ZNF266Q14584 549 aa14.6□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.6□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 Q6ZNX1 250 aa14.6□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 A0A087X0K7 114 aa14.59□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 DEFB1P60022 68 aa14.59□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 FAM78BQ5VT40 261 aa14.59□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 IGFL4Q6B9Z1 124 aa14.59□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 RFNGQ9Y644 331 aa14.59□□□□□ -0.07
HLA-B-255ENST00000498007 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.58□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 H3BTX0 84 aa14.58□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa14.58□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa14.58□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 LRRC20Q8TCA0 184 aa14.58□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 C20orf173Q96LM9 149 aa14.58□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa14.57□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa14.57□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 DEFB135Q30KP9 77 aa14.57□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.57□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 KIR2DL5AQ8N109 375 aa14.57□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 RNF182Q8N6D2 247 aa14.57□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa14.57□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa14.56□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 IGLC2P0DOY2 106 aa14.56□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 GDF5OSQ5U4N7 250 aa14.56□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 LCN15Q6UWW0 184 aa14.56□□□□□ -0.08
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HLA-B-255ENST00000498007 F6UB75 175 aa14.55□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 HLA-DMBP28068 263 aa14.55□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 FOXI2Q6ZQN5 318 aa14.55□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.55□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.55□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 AGRNO00468 2067 aa14.54□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa14.54□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 H3BQ15 152 aa14.54□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 SLC17A3O00476 420 aa14.54□□□□□ -0.08
HLA-B-255ENST00000498007 UBE2CO00762 179 aa14.54□□□□□ -0.08
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