RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	MEOX2	P50222	304 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM219A	Q8IW50	185 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	C18orf15	Q96N68	181 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01587	Q99440	93 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511		Q9H3A6	140 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNG5	Q9UF02	275 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	FAT1	Q14517	4588 aa		7.52	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	GABARAP	H6UMI1	98 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SOCS3	O14543	225 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	GABARAP	O95166	117 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFAIP8	O95379	198 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	IFNA5	P01569	189 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	GALR1	P47211	349 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR141	Q7Z602	305 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	BAP18	Q8IXM2	172 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFAND1	Q8TCF1	268 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A22	Q9H936	323 aa		7.51	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0J9YY99	117 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PPQ1	181 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GALNT1	O75752	331 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	AZU1	P20160	251 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	UCP1	P25874	307 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPO	P30536	169 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ERVFC1-1	P60608	527 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOB	P62745	196 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF90	Q03938	601 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	OR2F1	Q13607	317 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	NEDD8	Q15843	81 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35E1	Q96K37	410 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB26	Q9ULW5	256 aa		7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM8B	Q9Y5J9	83 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAP1	O75689	374 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5AC1	P0C628	307 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	M6PR	P20645	277 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TGFBR1	P36897	503 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	FGL1	Q08830	312 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	AMTN	Q6UX39	209 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	C16orf74	Q96GX8	76 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	RSG1	Q9BU20	258 aa		7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00315	P59091	139 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R60	P59551	318 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	LSM3	P62310	102 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	GAMT	Q14353	236 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	MEF2D	Q14814	521 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	AARD	Q4LEZ3	155 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	NMS	Q5H8A3	153 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	LGI3	Q8N145	548 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF738	Q8NE65	137 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511		U3KQ87	197 aa		7.48	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	MYCBP2	O75592	4640 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CDS2	O95674	445 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	CD3D	P04234	171 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT1A3	P0DMM9	295 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT1A4	P0DMN0	295 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ELK1	P19419	428 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	XG	P55808	180 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	ESRG	Q1W209	222 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	TERB2	Q8NHR7	220 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCH1	Q8TCQ1	289 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	DTD1	Q8TEA8	209 aa		7.47	□□□□□ -1.21
SKAP2-209	ENST00000497511	UPK3B	Q9BT76	320 aa		7.47	□□□□□ -1.21

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