RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483697.2

PRKCI-204, Transcript of protein kinase C iota, human

TSL 3

Gene PRKCI, Length 267 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCI-204	ENST00000483697	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	HBE1	P02100	147 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	DTYMK	P23919	212 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	TFPI2	P48307	235 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	AMT	P48728	403 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	TAS2R60	P59551	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	GUK1	Q16774	197 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	RBKS	Q9H477	322 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	UPK2	O00526	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	SLC17A2	O00624	439 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	GNRHR	P30968	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	TAS2R31	P59538	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	RAB4B	P61018	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	WT1-AS	Q06250	92 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	BSX	Q3C1V8	233 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	PTH2	Q96A98	100 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRKCI-204	ENST00000483697	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697		I3L2K1	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	MFNG	O00587	321 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	GYG2	O15488	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	GNB3	P16520	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	MYL12A	P19105	171 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	CRHBP	P24387	322 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	OR1P1	Q8NH06	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	AP3S1	Q92572	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697		Q9H3A6	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	RFNG	Q9Y644	331 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697		A0A1W2PS18	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697		H3BMM0	161 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	HPGDS	O60760	199 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	HPRT1	P00492	218 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	UCHL1	P09936	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	OR13C7	P0DN81	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	DHODH	Q02127	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	ASAH1	Q13510	395 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	URB1-AS1	Q96HZ7	61 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	PRRT1	Q99946	306 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PRKCI-204	ENST00000483697	IGKV1D-13	A0A0B4J2D9	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.1 ms