RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-211	ENST00000467464		K7EPK0	472 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	DLK1	P80370	383 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	ARL16	Q0P5N6	197 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	PATE2	Q6UY27	113 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	RNF182	Q8N6D2	247 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	MITD1	Q8WV92	249 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	C16orf92	Q96LL3	132 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	GPR82	Q96P67	336 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	DOK5	Q9P104	306 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	DKK2	Q9UBU2	259 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	RFNG	Q9Y644	331 aa		8.53	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		8.52	□□□□□ -1.04
PTPRF-211	ENST00000467464	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	TMEM189	A5PLL7	270 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	FNDC10	F2Z333	226 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	IFNA21	P01568	189 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	LINC00869	P0C866	280 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	INPP1	P49441	399 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	TAS2R30	P59541	319 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	C4orf46	Q504U0	113 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	UHRF2	Q96PU4	802 aa		8.52	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464		A0A087X0K7	114 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	SMCO3	A2RU48	225 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	IL5	P05113	134 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	EMP1	P54849	157 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		8.51	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	C7orf66	A4D0T2	115 aa		8.5	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464		M0R2Z0	102 aa		8.5	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	CCS	O14618	274 aa		8.5	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	TSC22D2	O75157	780 aa		8.5	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	HYPM	O75409	117 aa		8.5	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	SELENOT	P62341	195 aa		8.5	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	SLC38A11	Q08AI6	406 aa		8.5	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		8.5	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	NPVF	Q9HCQ7	196 aa		8.5	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		8.5	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	PLAC8L1	A1L4L8	177 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	CENPX	A8MT69	81 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	LYRM1	O43325	122 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	SCGB1D2	O95969	90 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	HBE1	P02100	147 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	PRM2	P04554	102 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	CXCL3	P19876	107 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	RAP2B	P61225	183 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	OXA1L	Q15070	435 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	8.49	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	AGPAT2	O15120	278 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	TCRB	P04435	133 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	RRN3P1	Q2M238	152 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	MORN5	Q5VZ52	161 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	TEPP	Q6URK8	271 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	BAP18	Q8IXM2	172 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	MGST2	Q99735	147 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	ARL6	Q9H0F7	186 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	ARV1	Q9H2C2	271 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		8.48	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	OR5G3	P0C626	314 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464		P0DMU3	169 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM231A	P0DMU4	169 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	FAM231C	P0DMU5	169 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	S100A7	P31151	101 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	FGL1	Q08830	312 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	IL15RA	Q13261	267 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF546	Q86UE3	836 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	ZNF738	Q8NE65	137 aa		8.47	□□□□□ -1.05
PTPRF-211	ENST00000467464	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		8.47	□□□□□ -1.05

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