RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	S100A10	P60903	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ERVK-16	P61578	105 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RND3	P61587	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	EBI3	Q14213	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4X1	Q8NH49	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PIFO	Q8TCI5	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SMIM3	Q9BZL3	60 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR51J1	Q9H342	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00473	A8K010	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	COLCA2	A8K830	154 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		J3KT08	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		J3QR89	54 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RRH	O14718	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	MPPED1	O15442	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFB6	O95139	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPY1R	P25929	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	LEP	P41159	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	LPAR6	P43657	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNG4	P50150	75 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC00205	P59089	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FHL2	Q14192	279 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4F5	Q8NH21	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	DDB2	Q92466	427 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPR146	Q96CH1	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TUBA4B	Q9H853	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACAN	P16112	2415 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1B0GX51	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		B5MCH6	92 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		M0R2Z0	102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLA2G10	O15496	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2A4	O95047	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFA3	O95167	84 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	MPC2	O95563	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	AKR1C2	P52895	323 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	XG	P55808	180 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SRPX	P78539	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q8N6K4	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q8N9W7	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NPB	Q8NG41	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2A7	Q96R45	310 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLCC1	Q96S66	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0G2JLM5	398 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4C46	A6NHA9	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	TAAR5	O14804	337 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	SFT2D2	O95562	160 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ECHDC1-208	ENST00000436638	NMB	P08949	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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