RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF79Q15937 498 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLK9Q2XQG4 91 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 PYDC2Q56P42 97 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF600Q6ZNG1 722 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYG2Q86SG7 212 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUSP18Q8NEJ0 188 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TERB2Q8NHR7 220 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRRT1Q99946 306 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 OVOL2Q9BRP0 275 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 PBDC1Q9BVG4 233 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMPXQ9UHP9 88 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR132Q9UNW8 380 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 V9GYH0 126 aa3.23□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 FABP12A6NFH5 140 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 KNCNA6PVL3 124 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 E5RGE8 158 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CORTO00230 105 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCGB2A1O75556 95 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATG12O94817 140 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNA10P01566 189 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL4P05112 153 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SULT1A3P0DMM9 295 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SULT1A4P0DMN0 295 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 C4BPBP20851 252 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR10J1P30954 320 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 P2RY1P47900 373 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPBWR1P48145 328 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMBIM6P55061 237 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB131AP59861 70 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPCS3P61009 180 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFRSF9Q07011 255 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMEM187Q14656 261 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYZL2Q7Z4W2 148 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR1S1Q8NH92 325 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 DTD1Q8TEA8 209 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPR146Q96CH1 333 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR10C1Q96KK4 312 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL26Q96S19 204 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 RBKSQ9H477 322 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC5AQ9NY25 188 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa3.22□□□□□ -1.89
RPS3AP54-201ENST00000435535 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLN5O75503 358 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDS2O95674 445 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 LY6G6CO95867 125 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGKV1-17P01599 117 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 IFNA4P05014 189 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 IGLC1P0CG04 106 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 S100A5P33763 92 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMI1P35226 326 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 HTR2BP41595 481 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 INPP1P49441 399 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCR6P51684 374 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAX9P55771 341 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 XGP55808 180 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 DEFB1P60022 68 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 LYZP61626 148 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHODHQ02127 395 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHRS2Q13268 280 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPP1R1AQ13522 171 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2F1Q13607 317 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMCO1Q147U7 214 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 BSXQ3C1V8 233 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFP69Q49AA0 526 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 NMSQ5H8A3 153 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSMG4Q5JS54 123 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTL10Q5JWF8 245 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIQKQ629K1 86 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 Q6ZRP5 223 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 STHQ8IWL8 128 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR11H2Q8NH07 326 aa3.21□□□□□ -1.9
RPS3AP54-201ENST00000435535 GALNT14Q96FL9 552 aa3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.2 ms