RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV2A0A0B4J234 112 aa4.7□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 TRAV10A0A0B4J240 114 aa4.7□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 M0R2N4 97 aa4.7□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 GNG7O60262 68 aa4.7□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM50AO95807 157 aa4.7□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 PAFAH1B2P68402 229 aa4.7□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 MUC4Q99102 2169 aa4.69□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 HSPG2P98160 4391 aa4.69□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 ATG12O94817 140 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV1-5P01602 117 aa4.68□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 P0C879 139 aa4.68□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 S100A10P60903 97 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 A0A0G2JRQ6 117 aa4.68□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 SCGB1D2O95969 90 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV1-17P01599 117 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 CD5P06127 495 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 SPP1P10451 314 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 P2RY1P47900 373 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 NPBWR1P48145 328 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 RAB32Q13637 225 aa4.68□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa4.68□□□□□ -1.66
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HOXD8-202ENST00000429017 CT83Q5H943 113 aa4.67□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 Q6ZR54 194 aa4.67□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35G3Q8N808 338 aa4.67□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 PHYHIPLQ96FC7 376 aa4.67□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.67□□□□□ -1.66
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