RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 TOMM40O96008 361 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 RAB4AP20338 218 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 HTR1DP28221 377 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 PRSS22Q9GZN4 317 aa12.29□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 M0R3E3 92 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 Q86TA4 180 aa12.28□□□□□ -0.44
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NISCH-202ENST00000420808 NBR2O15453 112 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 P01737 135 aa12.28□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
NISCH-202ENST00000420808 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.28□□□□□ -0.44
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NISCH-202ENST00000420808 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa12.27□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 ZNF491Q8N8L2 437 aa12.27□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 ZNF138P52744 262 aa12.26□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 SSTP61278 116 aa12.26□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 F8W735 103 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 OTORQ9NRC9 128 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 LOC105371242A0A075B767 164 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 C11orf71Q6IPW1 123 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 OR11H6Q8NGC7 330 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 CELSR2Q9HCU4 2923 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 TRBV19A0A075B6N1 114 aa12.25□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 H3BRN7 92 aa12.25□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 OR2J3O76001 311 aa12.24□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 C5orf64Q2M2E5 130 aa12.24□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 C8orf49Q96NF6 230 aa12.24□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 A8MWL6 223 aa12.23□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 Q56UQ5 140 aa12.23□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 FAM120AOSQ5T036 256 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 NPBQ8NG41 125 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 BORCS7Q96B45 105 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 ZNF492Q9P255 531 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 NPIPB6E9PJ23 425 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 NDUFB8O95169 186 aa12.22□□□□□ -0.45
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NISCH-202ENST00000420808 PRTN3P24158 256 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 ZNF414Q96IQ9 312 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 CHRDL1Q9BU40 450 aa12.22□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa12.21□□□□□ -0.45
NISCH-202ENST00000420808 MUC21A0A140T8X8 626 aa12.21□□□□□ -0.45
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