RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM50AO95807 157 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 UCP1P25874 307 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 EMP1P54849 157 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 OPCMLQ14982 345 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 BSXQ3C1V8 233 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 C17orf77Q96MU5 243 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 NEU1Q99519 415 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.52□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM189A5PLL7 270 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 K7EQG2 157 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ATG12O94817 140 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 S100A11P31949 105 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 S100A10P60903 97 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 IFITM2Q01629 132 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 OR2F1Q13607 317 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFA5Q16718 116 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ACTL10Q5JWF8 245 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 FAM222AQ5U5X8 452 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TMUB2Q71RG4 321 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ARL6Q9H0F7 186 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 RABAC1Q9UI14 185 aa11.51□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 CORTO00230 105 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 CDS2O95674 445 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 IFNA7P01567 189 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 CXCL2P19875 107 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SNCAP37840 140 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 AARDQ4LEZ3 155 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 Q6ZSN1 163 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 MBD2Q9UBB5 411 aa11.5□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 CLN5O75503 358 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SCGB1D2O95969 90 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV1-17P01599 117 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF688P0C7X2 276 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF345Q14585 488 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 MLANAQ16655 118 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SYT8Q8NBV8 401 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 OR4X1Q8NH49 305 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 LHFPL5Q8TAF8 219 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 XCL2Q9UBD3 114 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TNFSF18Q9UNG2 199 aa11.49□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 CRYBB3P26998 211 aa11.48□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 OPRK1P41145 380 aa11.48□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 RAB32Q13637 225 aa11.48□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.48□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.48□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP11.47□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 IL15RAQ13261 267 aa11.47□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.47□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 RNF213Q63HN8 5207 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM9A6NGZ8 99 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 E5RGE8 158 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A6P12236 298 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 NPPCP23582 126 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 P2RY1P47900 373 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.46□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 34.3
SPCS1-201ENST00000233025 TIGITQ495A1 244 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TEX261Q6UWH6 196 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 SLC51BQ86UW2 128 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 STXBP6Q8NFX7 210 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 DCANP1Q8TF63 244 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 METTL26Q96S19 204 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 U3KQ87 197 aa11.46□□□□□ -0.57
SPCS1-201ENST00000233025 WRBO00258 174 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 BCL2L11O43521 198 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 IGLC1P0CG04 106 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 SPCS3P61009 180 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 RAB14P61106 215 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 VAMP2P63027 116 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 FAM219AQ8IW50 185 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 OR52E5Q8NH55 327 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 OR1S1Q8NH92 325 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 RAB40CQ96S21 281 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 ARPC5LQ9BPX5 153 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 ENY2Q9NPA8 101 aa11.45□□□□□ -0.58
SPCS1-201ENST00000233025 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.45□□□□□ -0.58
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