RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 CRBNQ96SW2 442 aa27.39■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
SLC35A3-216ENST00000639221 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SLC35A3-216ENST00000639221 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SLC35A3-216ENST00000639221 IREB2P48200 963 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
SLC35A3-216ENST00000639221 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC35A3-216ENST00000639221 GAKO14976 1311 aa27.38■■□□□ 1.97
SLC35A3-216ENST00000639221 UNCXA6NJT0 531 aa27.37■■□□□ 1.97
SLC35A3-216ENST00000639221 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
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SLC35A3-216ENST00000639221 CACNB3P54284 484 aa27.36■■□□□ 1.97
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SLC35A3-216ENST00000639221 TMEM39BQ9GZU3 492 aa27.36■■□□□ 1.97
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SLC35A3-216ENST00000639221 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SLC35A3-216ENST00000639221 SLC10A3P09131 477 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC35A3-216ENST00000639221 BTDP43251 543 aa27.34■■□□□ 1.97
SLC35A3-216ENST00000639221 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
SLC35A3-216ENST00000639221 MAP3K11Q16584 847 aa27.34■■□□□ 1.97
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SLC35A3-216ENST00000639221 DCAF15Q66K64 600 aa27.33■■□□□ 1.97
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SLC35A3-216ENST00000639221 WBP1LQ9NX94 342 aa27.33■■□□□ 1.97
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SLC35A3-216ENST00000639221 TEPSINQ96N21 525 aa27.32■■□□□ 1.96
SLC35A3-216ENST00000639221 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.32■■□□□ 1.96
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SLC35A3-216ENST00000639221 LDLRAD1Q5T700 205 aa27.31■■□□□ 1.96
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SLC35A3-216ENST00000639221 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
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SLC35A3-216ENST00000639221 ENTPD3O75355 529 aa27.3■■□□□ 1.96
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SLC35A3-216ENST00000639221 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.23■■□□□ 1.95
SLC35A3-216ENST00000639221 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
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SLC35A3-216ENST00000639221 WRNIP1Q96S55 665 aa27.22■■□□□ 1.95
SLC35A3-216ENST00000639221 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP27.22■■□□□ 1.95
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SLC35A3-216ENST00000639221 SPRYD7Q5W111 196 aa27.21■■□□□ 1.95
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