RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631641.1

DDX3X-222, Transcript of DEAD-box helicase 3 X-linked, human

TSL 3

Gene DDX3X, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX3X-222	ENST00000631641	ATP2B3	Q16720	1220 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	OPTN	Q96CV9	577 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SEMA3E	O15041	775 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	GTF2A2	P52657	109 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CACNB3	P54284	484 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CRHR2	Q13324	411 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	MTX1	Q13505	466 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CEP85	Q6P2H3	762 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ERO1A	Q96HE7	468 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SIL1	Q9H173	461 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		10.26	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	OTUD5	Q96G74	571 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	WRNIP1	Q96S55	665 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PTPN18	Q99952	460 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	COPRS	Q9NQ92	184 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	TRIM17	Q9Y577	477 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		10.25	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CENPF	P49454	3210 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ZBTB22	O15209	634 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	HMMR	O75330	724 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ATP8B2	P98198	1209 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SP3	Q02447	781 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ARHGEF6	Q15052	776 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CCL15	Q16663	113 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ERO1B	Q86YB8	467 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SSH3	Q8TE77	659 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.24	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CETP	P11597	493 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PRDX5	P30044	214 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SNAPC2	Q13487	334 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	POLA2	Q14181	598 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	EFCC1	Q9HA90	598 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		10.23	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	LAMB1	P07942	1786 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SRGAP3	O43295	1099 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PHKA1	P46020	1223 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PPIL2	Q13356	520 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CCDC102B	Q68D86	513 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		10.22	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	OTOF	Q9HC10	1997 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	IRF6	O14896	467 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	IGHD	P01880	384 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PPAT	Q06203	517 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	USP40	Q9NVE5	1235 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		10.21	□□□□□ -0.77
DDX3X-222	ENST00000631641		A0A1B0GUL7	405 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX3X-222	ENST00000631641	GAK	O14976	1311 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX3X-222	ENST00000631641	TLR2	O60603	784 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX3X-222	ENST00000631641	SLC34A2	O95436	690 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX3X-222	ENST00000631641	ADORA1	P30542	326 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX3X-222	ENST00000631641	TCP10	Q12799	353 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX3X-222	ENST00000631641	NFIA	Q12857	509 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX3X-222	ENST00000631641	RASGRF1	Q13972	1273 aa		10.2	□□□□□ -0.78
DDX3X-222	ENST00000631641	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78

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