RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 MCAMP43121 646 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 NFIAQ12857 509 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM83AQ86UY5 434 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 WNK4Q96J92 1243 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ELP3Q9H9T3 547 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPR108Q9NPR9 543 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNRKQ9NRH2 765 aa21.87■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB22O15209 634 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 BCL11AQ9H165 835 aa21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 APBB1O00213 710 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TBC1D8O95759 1140 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MECOMQ03112 1051 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SREBF2Q12772 1141 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 RAI14Q9P0K7 980 aa21.85■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 GJA5P36382 358 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 BTDP43251 543 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM151AQ8WW52 585 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 GAKO14976 1311 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 TM4SF4P48230 202 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP3K9P80192 1104 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 VGLL4Q14135 290 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLF2Q8IX21 1173 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 OPTNQ96CV9 577 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.83■■□□□ 1.09
CTDNEP1-207ENST00000572043 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 UNCXA6NJT0 531 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF384Q8TF68 577 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 WRNIP1Q96S55 665 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSADQ9Y600 493 aa21.82■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 RGS3P49796 1198 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 PICALMQ13492 652 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 AACSQ86V21 672 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZAP70P43403 619 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCAF15Q66K64 600 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 HOOK2Q96ED9 719 aa21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 HMMRO75330 724 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 GSTO1P78417 241 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 PDE3AQ14432 1141 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 OTUD5Q96G74 571 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 DGKZQ13574 1117 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFNL1Q8IU54 200 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 ABHD8Q96I13 439 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.78■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 LDHCP07864 332 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 INPP5BP32019 993 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 IDI2Q9BXS1 227 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
CTDNEP1-207ENST00000572043 INHBEP58166 350 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 RHBDL3P58872 404 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.76■■□□□ 1.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ENTPD3O75355 529 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 SLURP2P0DP57 97 aa21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
CTDNEP1-207ENST00000572043 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms