RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552897.5

TPCN1-222, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 4

Gene TPCN1, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-222	ENST00000552897	BTD	P43251	543 aa		29.51	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		29.51	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	29.51	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		29.51	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	TNFAIP1	Q13829	316 aa		29.5	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	PRKG1	Q13976	671 aa		29.5	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		29.5	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		29.5	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	SLF2	Q8IX21	1173 aa		29.5	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	29.5	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		29.49	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	GSTO1	P78417	241 aa		29.49	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	29.49	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		29.49	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		29.49	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	LDHC	P07864	332 aa		29.48	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	RHBDL3	P58872	404 aa		29.48	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		29.48	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	JMY	Q8N9B5	988 aa		29.48	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	GCC1	Q96CN9	775 aa		29.48	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		29.48	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	29.47	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	TNNI2	P48788	182 aa		29.47	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	FKBP1B	P68106	108 aa		29.47	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		29.47	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	29.47	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM83A	Q86UY5	434 aa		29.47	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		29.47	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	CAPNS2	Q96L46	248 aa		29.47	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	29.47	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	GOLIM4	O00461	696 aa		29.46	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	NF2	P35240	595 aa		29.46	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	TCP10	Q12799	353 aa		29.46	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	HAUS7	Q99871	368 aa		29.46	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		29.46	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		29.46	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		29.45	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	29.45	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	GRM1	Q13255	1194 aa		29.45	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	29.45	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		29.45	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	SMC5	Q8IY18	1101 aa		29.45	■■■□□ 2.31
TPCN1-222	ENST00000552897	RGMB	Q6NW40	437 aa		29.44	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM151A	Q8WW52	585 aa		29.44	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	IDI2	Q9BXS1	227 aa		29.44	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	29.44	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	29.44	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	CYP7A1	P22680	504 aa		29.43	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	RGS3	P49796	1198 aa		29.43	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		29.43	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	AOC2	O75106	756 aa		29.42	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	29.42	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		29.42	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	29.42	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		29.42	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		29.41	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	29.41	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	IGSF3	O75054	1194 aa		29.41	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP3K12	Q12852	859 aa		29.41	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	29.41	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		29.41	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		29.41	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	29.41	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	ZIC5	Q96T25	663 aa		29.41	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	DOCK2	Q92608	1830 aa		29.41	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	ECE1	P42892	770 aa		29.4	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	29.4	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP4C	P60510	307 aa		29.4	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	29.4	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP3K11	Q16584	847 aa		29.4	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		29.4	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		29.4	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	PCNT	O95613	3336 aa		29.4	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		29.39	■■■□□ 2.3
TPCN1-222	ENST00000552897	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	ENTPD3	O75355	529 aa		29.38	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	CHGB	P05060	677 aa		29.38	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	PDE6A	P16499	860 aa		29.38	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	PICALM	Q13492	652 aa		29.38	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		29.38	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		29.38	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	TEX11	Q8IYF3	940 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	GPATCH3	Q96I76	525 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	LNPK	Q9C0E8	428 aa		29.37	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	BAG3	O95817	575 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	SLC10A3	P09131	477 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		29.36	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	SLURP2	P0DP57	97 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	MX1	P20591	662 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		29.35	■■■□□ 2.29
TPCN1-222	ENST00000552897	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	29.35	■■■□□ 2.29

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