RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.26■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 PPIL2Q13356 520 aa21.25■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.25■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 MYCP01106 439 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 FAM151AQ8WW52 585 aa21.24■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.24■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 BRCA2P51587 3418 aa21.23■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 INPP5BP32019 993 aa21.23■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 PPATQ06203 517 aa21.23■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 TCP10Q12799 353 aa21.23■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.22■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 ATG9AQ7Z3C6 839 aa21.22■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 SH3TC2Q8TF17 1288 aa21.22■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 SIL1Q9H173 461 aa21.22■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.21■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 SLFN5Q08AF3 891 aa21.21■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.21■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.21■□□□□ 0.99
CS-214ENST00000548849 GNRH1P01148 92 aa21.2■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 PRDX5P30044 214 aa21.2■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 ATP2B3Q16720 1220 aa21.2■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.2■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.2■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 USP40Q9NVE5 1235 aa21.2■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.2■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 AK9Q5TCS8 1911 aa21.19■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 LDHBP07195 334 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 NFIAQ12857 509 aa21.19■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 CPA4Q9UI42 421 aa21.19■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.19■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 PDHXO00330 501 aa21.18■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 PRMT2P55345 433 aa21.18■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 C17orf99Q6UX52 265 aa21.18■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 ANKRD23Q86SG2 305 aa21.18■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 ZNF112Q9UJU3 913 aa21.18■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 FBXO3Q9UK99 471 aa21.18■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 CIAO1O76071 339 aa21.17■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.17■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 DENND2AQ9ULE3 1009 aa21.17■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.17■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 PSMC4P43686 418 aa21.16■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.16■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 HOXD10P28358 340 aa21.15■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 PHKA1P46020 1223 aa21.15■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.15■□□□□ 0.98
CS-214ENST00000548849 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.14■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 SEMA3EO15041 775 aa21.14■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 CTGFP29279 349 aa21.14■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 TRIM47Q96LD4 638 aa21.14■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 SRRDQ9UH36 339 aa21.14■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.14■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 OSBPP22059 807 aa21.13■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 RAET1EQ8TD07 263 aa21.13■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 CXCL11O14625 94 aa21.12■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 MOGSQ13724 837 aa21.12■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 MTFR1Q15390 333 aa21.12■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 ADGRA2Q96PE1 1338 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 ADORA1P30542 326 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 RGS3P49796 1198 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 CCDC102BQ68D86 513 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 PICK1Q9NRD5 415 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 ABCF2Q9UG63 623 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 MYPNQ86TC9 1320 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 ENTPD3O75355 529 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 CYP2C8P10632 490 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 GRK4P32298 578 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 TIMM10P62072 90 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 GPAT2Q6NUI2 795 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 SCYL3Q8IZE3 742 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 IDI2Q9BXS1 227 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 COPRSQ9NQ92 184 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 SLF2Q8IX21 1173 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-214ENST00000548849 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms