RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 MECOMQ03112 1051 aa23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 PRKG1Q13976 671 aa23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 AACSQ86V21 672 aa23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.33■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 SNRKQ9NRH2 765 aa23.33■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 USP40Q9NVE5 1235 aa23.33■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 FZD1Q9UP38 647 aa23.33■■□□□ 1.33
NISCH-209ENST00000485765 IGSF3O75054 1194 aa23.32■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 ZAP70P43403 619 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 FAM151AQ8WW52 585 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 AIDAQ96BJ3 306 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 IDI2Q9BXS1 227 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 APBB1O00213 710 aa23.3■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 LDHCP07864 332 aa23.3■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 GSTO1P78417 241 aa23.3■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 DCTPP1Q9H773 170 aa23.3■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.3■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.3■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 NFIAQ12857 509 aa23.29■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 CSRNP1Q96S65 589 aa23.29■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 RAI14Q9P0K7 980 aa23.29■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.29■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 BTDP43251 543 aa23.28■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.27■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 RHBDL3P58872 404 aa23.27■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 HOOK2Q96ED9 719 aa23.27■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.27■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 CRBNQ96SW2 442 aa23.27■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.27■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
NISCH-209ENST00000485765 CA12O43570 354 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 ENTPD3O75355 529 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 SPRYD7Q5W111 196 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.26■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 TCP10Q12799 353 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 ZFPM1Q8IX07 1006 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 TM4SF4P48230 202 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 RGS3P49796 1198 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 MAP3K9P80192 1104 aa23.24■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 PPP4CP60510 307 aa23.23■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.23■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.23■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 LBX1P52954 281 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 AAMPQ13685 434 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 DCAF15Q66K64 600 aa23.22■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 ATP5JP18859 108 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 MAP3K10Q02779 954 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 WNK4Q96J92 1243 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 RNF186Q9NXI6 227 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-209ENST00000485765 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 GJA5P36382 358 aa23.2■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 MIGA2Q7L4E1 593 aa23.2■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 BAG3O95817 575 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 VGLL4Q14135 290 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 ZNF341Q9BYN7 854 aa23.19■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
NISCH-209ENST00000485765 INHBEP58166 350 aa23.18■■□□□ 1.3
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