RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UIMC1Q96RL1 719 aa18.77■□□□□ 0.6
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHOXF2Q9BQY4 288 aa18.77■□□□□ 0.6
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 E7EWF7 191 aa18.77■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF202O95125 648 aa18.77■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP5JP18859 108 aa18.77■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KRT40Q6A162 431 aa18.77■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASEFQ8IZ41 740 aa18.77■□□□□ 0.59
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP18.77■□□□□ 0.59
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