RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, human

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP4-208	ENST00000462602	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	BACH2	Q9BYV9	841 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	MYH7	P12883	1935 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPDYE6	P0CI01	402 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	USP40	Q9NVE5	1235 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	APP	P05067	770 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	USP5	P45974	858 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	RHBDL3	P58872	404 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	TEX11	Q8IYF3	940 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	IL25	Q9H293	177 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	HACL1	Q9UJ83	578 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	WNT10B	O00744	389 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	EPS15	P42566	896 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ALX1	Q15699	326 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	MCC	P23508	829 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	IDI2	Q9BXS1	227 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	NAPB	Q9H115	298 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	PRKAB2	O43741	272 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	SEC24B	O95487	1268 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	EPHX2	P34913	555 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	TDO2	P48775	406 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	PTH1R	Q03431	593 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	TNFAIP1	Q13829	316 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	VPS53	Q5VIR6	699 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	RNF20	Q5VTR2	975 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SH3BP4-208	ENST00000462602	ENTPD3	O75355	529 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	FGA	P02671	866 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TNNI2	P48788	182 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	VEZT	Q9HBM0	779 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	FLT1	P17948	1338 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	CLRN2	A0PK11	232 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	FOXP2	O15409	715 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	EGFR	P00533	1210 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
SH3BP4-208	ENST00000462602	PICALM	Q13492	652 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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