RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.56■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.56■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 MYO1BO43795 1136 aa23.56■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 BAG3O95817 575 aa23.56■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.362e-20■■■■■ 37.5
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SNHG12-201ENST00000461448 CDC45O75419 566 aa23.55■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.55■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 USP40Q9NVE5 1235 aa23.55■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.55■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 CLRN2A0PK11 232 aa23.55■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 APPBP2Q92624 585 aa23.55■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.54■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.54■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.54■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.54■■□□□ 1.36
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SNHG12-201ENST00000461448 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
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SNHG12-201ENST00000461448 POTEJP0CG39 1038 aa23.52■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 PPP4CP60510 307 aa23.52■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.52■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 OSBP2Q969R2 916 aa23.52■■□□□ 1.36
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SNHG12-201ENST00000461448 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.52■■□□□ 1.36
SNHG12-201ENST00000461448 MYH7P12883 1935 aa23.52■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 PLCG2P16885 1265 aa23.51■■□□□ 1.35
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SNHG12-201ENST00000461448 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 CERS3Q8IU89 383 aa23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 AIDAQ96BJ3 306 aa23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 FAM227BQ96M60 508 aa23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 GGA3Q9NZ52 723 aa23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 MBD4O95243 580 aa23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 CACNB3P54284 484 aa23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 RHBDL3P58872 404 aa23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 ARMT1Q9H993 441 aa23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.51■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 M0R2C6 588 aa23.5■■□□□ 1.35
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SNHG12-201ENST00000461448 TEX11Q8IYF3 940 aa23.5■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 LCORLQ8N3X6 602 aa23.5■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 A0A0D9SFI3 127 aa23.49■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 KIF3CO14782 793 aa23.49■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 LDHDQ86WU2 507 aa23.49■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.48■■□□□ 1.35
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SNHG12-201ENST00000461448 RAD50Q92878 1312 aa23.48■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.48■■□□□ 1.35
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SNHG12-201ENST00000461448 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.48■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 GPAA1O43292 621 aa23.47■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.47■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 USP5P45974 858 aa23.46■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 NFIAQ12857 509 aa23.46■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 PICALMQ13492 652 aa23.46■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.46■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.46■■□□□ 1.35
SNHG12-201ENST00000461448 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 SULF1Q8IWU6 871 aa23.45■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa23.45■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 PRKAB2O43741 272 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 TNNI2P48788 182 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 TCP10Q12799 353 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 TNFAIP1Q13829 316 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 IDI2Q9BXS1 227 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 CHADLQ6NUI6 762 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 USP48Q86UV5 1035 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 FAM198AQ9UFP1 575 aa23.44■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 GNAT2P19087 354 aa23.43■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 RASA3Q14644 834 aa23.43■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 CDC37L1Q7L3B6 337 aa23.43■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.43■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.43■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.43■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 ADM5C9JUS6 153 aa23.42■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 SGSM2O43147 1006 aa23.42■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.42■■□□□ 1.34
SNHG12-201ENST00000461448 ENTPD3O75355 529 aa23.41■■□□□ 1.34
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